RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SCYL2Q6P3W7 929 aa5.75□□□□□ -1.49
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CLSTN3-215ENST00000544584 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 DRC7Q8IY82 874 aa5.75□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 MCOLN2Q8IZK6 566 aa5.75□□□□□ -1.49
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CLSTN3-215ENST00000544584 BBS5Q8N3I7 341 aa5.75□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 LZTR1Q8N653 840 aa5.75□□□□□ -1.49
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CLSTN3-215ENST00000544584 FTLP02792 175 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D3HP0C7X1 549 aa5.74□□□□□ -1.49
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CLSTN3-215ENST00000544584 SCAPQ12770 1279 aa5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 OVGP1Q12889 678 aa5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 NR1I3Q14994 352 aa5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 NCAPHQ15003 741 aa5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 DLG2Q15700 870 aa5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 CST6Q15828 149 aa5.74□□□□□ -1.49
CLSTN3-215ENST00000544584 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
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