RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538860.1

ADD1-223, Transcript of adducin 1, human

TSL 3

Gene ADD1, Length 507 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-223	ENST00000538860	C9orf64	Q5T6V5	341 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	AFMID	Q63HM1	303 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PTPRN2	Q92932	1015 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	KLC2	Q9H0B6	622 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RSPH9	Q9H1X1	276 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	LRRC19	Q9H756	370 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ITM2C	Q9NQX7	267 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DNAI1	Q9UI46	699 aa		15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ALOX15B	O15296	676 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ARHGAP6	O43182	974 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RNASEH1	O60930	286 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RPP40	O75818	363 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	GOT1	P17174	413 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ERCC2	P18074	760 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	NDUFV2	P19404	249 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	IL4R	P24394	825 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	P2RY2	P41231	377 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SERINC3	Q13530	473 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DLG2	Q15700	870 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	IL31	Q6EBC2	164 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	OR7D4	Q8NG98	312 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	HMGB4	Q8WW32	186 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	LOXL4	Q96JB6	756 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RAD54B	Q9Y620	910 aa		15.18	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	TTC34	A8MYJ7	566 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RASA4B	C9J798	803 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DCLK1	O15075	740 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RASA4	O43374	803 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SRC	P12931	536 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	HLA-E	P13747	358 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	OXTR	P30559	389 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	TAS2R40	P59535	323 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	MAP7D1	Q3KQU3	841 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	KCTD6	Q8NC69	237 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	HSPH1	Q92598	858 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	FAF2	Q96CS3	445 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	CCDC114	Q96M63	670 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	FAM129B	Q96TA1	746 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF670	Q9BS34	389 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SPON2	Q9BUD6	331 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ALG6	Q9Y672	507 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860		R4GN57	208 aa		15.17	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	RCCD1	A6NED2	376 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	CBX4	O00257	560 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	MCF2L	O15068	1137 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SNAP91	O60641	907 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SIN3B	O75182	1162 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	CD160	O95971	181 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	MT-CO1	P00395	513 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ACVRL1	P37023	503 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	CDH6	P55285	790 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ARF5	P84085	180 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	USP30	Q70CQ3	517 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PGBD3	Q8N328	593 aa		15.16	■□□□□ 0.02
ADD1-223	ENST00000538860	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	15.16	■□□□□ 0.02

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms