RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	FRMD4B	Q9Y2L6	1034 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CEP83	Q9Y592	693 aa		12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MCF2L	O15068	1137 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MAPK13	O15264	365 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SPINT1	O43278	529 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ATP9B	O43861	1147 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CUTA	O60888	179 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	LTF	P02788	710 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SLC5A2	P31639	672 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PLK1	P53350	603 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CYP4F2	P78329	520 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TLE1	Q04724	770 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CLCA4	Q14CN2	919 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DLG2	Q15700	870 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CXorf57	Q6NSI4	855 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZVU0	165 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HORMAD1	Q86X24	394 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PAGE5	Q96GU1	130 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TCEAL2	Q9H3H9	227 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PREB	Q9HCU5	417 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RAB20	Q9NX57	234 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	DACH1	Q9UI36	760 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		12.49	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MT-CO1	P00395	513 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CSF2	P04141	144 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	GP1BB	P13224	206 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HGF	P14210	728 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CD19	P15391	556 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TACR2	P21452	398 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NR2F2	P24468	414 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TBR1	Q16650	682 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HS1BP3	Q53T59	392 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SGO2	Q562F6	1265 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	KRT39	Q6A163	491 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	USP53	Q70EK8	1073 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TAC4	Q86UU9	113 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SGF29	Q96ES7	293 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	USP29	Q9HBJ7	922 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	WDR70	Q9NW82	654 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		12.48	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NEMP2	A6NFY4	417 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557		K7ERQ8	282 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MUSK	O15146	869 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	BNIP3L	O60238	219 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	GCAT	O75600	419 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	MOCS3	O95396	460 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NTRK1	P04629	796 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ALPPL2	P10696	532 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CR2	P20023	1033 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	PDC	P20941	246 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SLC8A3	P57103	927 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IGFBP7	Q16270	282 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CBWD6	Q4V339	395 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	ARL14	Q8N4G2	192 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	CHST14	Q8NCH0	376 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		12.47	□□□□□ -0.41
BBS1-222	ENST00000533557	IFT43	Q96FT9	208 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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