RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529766.5

BBS1-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 1,590 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-215	ENST00000529766	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CCNB1	P14635	433 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	LTBR	P36941	435 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ACVRL1	P37023	503 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IL10RB	Q08334	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SEMA5A	Q13591	1074 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FYB2	Q5VWT5	728 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RELL1	Q8IUW5	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TEX26	Q8N6G2	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FUT8	Q9BYC5	575 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PDF	Q9HBH1	243 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	NUP205	Q92621	2012 aa		13.55	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766		J3KR12	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZBTB24	O43167	697 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	KDELR3	O43731	214 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PRAMEF11	O60813	436 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TBX10	O75333	385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	JCHAIN	P01591	159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FDFT1	P37268	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ANO4	Q32M45	955 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FSCB	Q5H9T9	825 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SMARCD2	Q92925	531 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ALG14	Q96F25	216 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	APOL5	Q9BWW9	433 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SEPT10	Q9P0V9	454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	EYS	Q5T1H1	3165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MAP2K7	O14733	419 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ATP8B1	O43520	1251 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TMEM63A	O94886	807 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RHOC	P08134	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TPSB2	P20231	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ETFB	P38117	255 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IFNAR2	P48551	515 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	RENBP	P51606	427 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TPSAB1	Q15661	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MCU	Q8NE86	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	DDI1	Q8WTU0	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	IRF7	Q92985	503 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	LMLN	Q96KR4	655 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	GBA3	Q9H227	469 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	MARK1	Q9P0L2	795 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CDH7	Q9ULB5	785 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	REV3L	O60673	3130 aa		13.54	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766		H0Y626	953 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ZMPSTE24	O75844	475 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	FCAR	P24071	287 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PLK1	P53350	603 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CDK16	Q00536	496 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	SLMAP	Q14BN4	828 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	TMEM25	Q86YD3	366 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	OR7D4	Q8NG98	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
BBS1-215	ENST00000529766	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.53	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms