RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TANKQ92844 425 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PKP2Q99959 881 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 RSAD1Q9HA92 442 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa10.31□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf72A4D263 438 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TADA2AO75478 443 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PSMC3P17980 439 aa10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 GSSP48637 474 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO36Q8NEA4 188 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 E2F7Q96AV8 911 aa10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 GIN1Q9NXP7 522 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 EPS15L1Q9UBC2 864 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 GRM5P41594 1212 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SEPT6Q14141 434 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ADGRE1Q14246 886 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FIBCD1Q8N539 461 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF778Q96MU6 729 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf26Q96N11 449 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 NUF2Q9BZD4 464 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SLC13A1Q9BZW2 595 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FAM105AQ9NUU6 356 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 PLOD2O00469 737 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SIN3BO75182 1162 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IL1BP01584 269 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 GNA12Q03113 381 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 BMT2Q1RMZ1 405 aa10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 RNF148Q8N7C7 305 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM121Q9BTD3 319 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 COLEC11Q9BWP8 271 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.3□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 HSPBP1Q9NZL4 362 aa10.3□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 MCF2LO15068 1137 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 GZMAP12544 262 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 SLC15A4Q8N697 577 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 TAMM41Q96BW9 452 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 TISP43B9A030 160 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 CCDC130P13994 396 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 TNFSF13BQ9Y275 285 aa10.29□□□□□ -0.76
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TRPS1-211ENST00000520276 MAPK10P53779 464 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM132DQ14C87 1099 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 MORF4L2Q15014 288 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 SEZ6Q53EL9 994 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CEP295NLQ96MC4 621 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 KREMEN1Q96MU8 473 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 CDH19Q9H159 772 aa10.29□□□□□ -0.76
TRPS1-211ENST00000520276 IFT122Q9HBG6 1241 aa10.29□□□□□ -0.76
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