RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519674.1

TRPS1-209, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 3,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-209ENST00000519674 FIBCD1Q8N539 461 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TTC9Q92623 222 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PCYT2Q99447 389 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MSTO1Q9BUK6 570 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CXorf21Q9HAI6 301 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 OTOFQ9HC10 1997 aa8.64□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SOWAHBA6NEL2 793 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SNTNA6NMZ2 147 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF839A8K0R7 811 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ADCY8P40145 1251 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PHC1P78364 1004 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NFATC3Q12968 1075 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 INAVAQ3KP66 663 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 WDR44Q5JSH3 913 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LILRA2Q8N149 483 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 BBOF1Q8ND07 529 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CPA5Q8WXQ8 436 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZNF597Q96LX8 424 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ELP3Q9H9T3 547 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TMEM9Q9P0T7 183 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FETUBQ9UGM5 382 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 A0A087WXM4 84 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FAM25EA8MYX2 175 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 AREL1O15033 823 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FAM189A1O60320 539 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MTA2O94776 668 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PROCP04070 461 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PGK2P07205 417 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 BGNP21810 368 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ARL2P36404 184 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GRM5P41594 1212 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 STAT5BP51692 787 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CDH15P55291 814 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PRKCQQ04759 706 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 LY6KQ17RY6 165 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SMU1Q2TAY7 513 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 EFHC2Q5JST6 749 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ACAD10Q6JQN1 1059 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZFP1Q6P2D0 407 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 FEM1CQ96JP0 617 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 COQ7Q99807 217 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 MCM3APO60318 1980 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C7orf72A4D263 438 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SDR42E2A6NKP2 422 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 H7C0C1 242 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CLPXO76031 633 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SLC26A2P50443 739 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 COPAP53621 1224 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CLDN10P78369 228 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 CAPSQ13938 189 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 TFDP1Q14186 410 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 AKAP14Q86UN6 197 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SULF1Q8IWU6 871 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 PDPRQ8NCN5 879 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf54Q8WWF1 131 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ACAP3Q96P50 834 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NANOGQ9H9S0 305 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 NEK6Q9HC98 313 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 GMIPQ9P107 970 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.63□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
TRPS1-209ENST00000519674 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa8.62□□□□□ -1.03
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