RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NCAN	O14594	1321 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	RFPL1	O75677	317 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CTDNEP1	O95476	244 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	AMY1A	P04745	511 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	WEE2	P0C1S8	567 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	GLRA2	P23416	452 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ACRV1	P26436	265 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MAN2A2	P49641	1150 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SCNN1G	P51170	649 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CTTN	Q14247	550 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	CDSN	Q15517	529 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	FUT10	Q6P4F1	479 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TPH2	Q8IWU9	490 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	MTMR9	Q96QG7	549 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PDE4D-222	ENST00000514552	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		7.4	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	CEP250	Q9BV73	2442 aa		7.4	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ANHX	E9PGG2	379 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	DTNB	O60941	627 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	LAMP2	P13473	410 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	PDC	P20941	246 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	MTM1	Q13496	603 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	HTR4	Q13639	388 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	IL10RA	Q13651	578 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	TRIM29	Q14134	588 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	AFMID	Q63HM1	303 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKS6	Q68DC2	871 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552		Q6ZRM9	215 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	XYLT1	Q86Y38	959 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	PALM2	Q8IXS6	379 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	PRR18	Q8N4B5	295 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ERMN	Q8TAM6	284 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	STON2	Q8WXE9	905 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	CPB2	Q96IY4	423 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	GPR87	Q9BY21	358 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	FZD8	Q9H461	694 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	HES2	Q9Y543	173 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	MYO10	Q9HD67	2058 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	B4GALT5	O43286	388 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	RFPL2	O75678	378 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ADRB1	P08588	477 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	DDC	P20711	480 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	PCSK1	P29120	753 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	MAGEA9	P43362	315 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	NAMPT	P43490	491 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	EFNA5	P52803	228 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	CLRN1	P58418	232 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	PPP2R5A	Q15172	486 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PDE4D-222	ENST00000514552	ANGPT1	Q15389	498 aa		7.38	□□□□□ -1.23

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