RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PGM5Q15124 567 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SURF1Q15526 300 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 UGCGQ16739 394 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 LGSNQ5TDP6 509 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ATG16L1Q676U5 607 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJC24Q6P3W2 148 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM154Q6P9G4 183 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PRUNE1Q86TP1 453 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 VPS52Q8N1B4 723 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 GLIS1Q8NBF1 620 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 IL31RAQ8NI17 732 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 BSNDQ8WZ55 320 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 STMN2Q93045 179 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 AZIN2Q96A70 460 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC39Q96DD0 335 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB10Q96DT7 871 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 RTP4Q96DX8 246 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 MTBPQ96DY7 904 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CDHR1Q96JP9 859 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SPATA33Q96N06 139 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF558Q96NG5 402 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 FNBP1Q96RU3 617 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PDCD2LQ9BRP1 358 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 FAM167BQ9BTA0 163 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 CHRDQ9H2X0 955 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 NPHS2Q9NP85 383 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 GPRC5CQ9NQ84 441 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 ARL8BQ9NVJ2 186 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SPG21Q9NZD8 308 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PADI3Q9ULW8 664 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa7.4□□□□□ -1.22
SMIM20-202ENST00000514384 APC2O95996 2303 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 A0A0B4J269 797 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LNP1A1A4G5 178 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CDC14CA4D256 554 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CFAP69A5D8W1 941 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF487B1APH4 448 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 FCHO1O14526 889 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SPINT1O43278 529 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MGEA5O60502 916 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM24O75264 130 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RFPL2O75678 378 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TM7SF2O76062 418 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ENDOD1O94919 500 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ASS1P00966 412 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 APOC2P02655 101 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 C1QAP02745 245 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PSAPP07602 524 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 MYL4P12829 197 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 KRT10P13645 584 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PRKCHP24723 683 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CRABP2P29373 138 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 NAMPTP43490 491 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CXCL12P48061 93 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SERPINB4P48594 390 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 LIG4P49917 911 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RAB27AP51159 221 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 CCR3P51677 355 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ACTR3P61158 418 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 WASHC5Q12768 1159 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TFDP1Q14186 410 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 GAS6Q14393 721 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 RCN1Q15293 331 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 HADHQ16836 314 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 XKR3Q5GH77 459 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 ZPBP2Q6X784 338 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 DSTYKQ6XUX3 929 aa7.39□□□□□ -1.23
SMIM20-202ENST00000514384 TIFABQ6ZNK6 161 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.5 ms