RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503393.6

SH3BP2-207, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-207ENST00000503393 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GMPPBQ9Y5P6 360 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TRMUO75648 421 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CNPP09543 421 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GALK1P51570 392 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 RENBPP51606 427 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 OLR1P78380 273 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 SPIDRQ14159 915 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ADGRF2Q8IZF7 708 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 DPYSL3Q14195 570 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BRINP3Q76B58 766 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 SEMA3DO95025 777 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BICRALQ6AI39 1079 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF621Q6ZSS3 439 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM216Q9P0N5 145 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PLOD3O60568 738 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 HPGDP15428 266 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 LBPP18428 481 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 RNF220Q5VTB9 566 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CIDEBQ9UHD4 219 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 MYL6P60660 151 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.86■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 DPPA5A6NC42 116 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CAPGP40121 348 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 A0A1W2PRG6 482 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BTNL10A8MVZ5 291 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 MATN2O00339 956 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 OR6B1O95007 311 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PSME3P61289 254 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PRKCQQ04759 706 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 STAU1O95793 577 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 NAGLUP54802 743 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TRIM38O00635 465 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ITGAVP06756 1048 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 S100A3P33764 101 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GSTM5P46439 218 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 RFX3P48380 749 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ILDR2Q71H61 639 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CDC42P60953 191 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PPP1R14AQ96A00 147 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 HGH1Q9BTY7 390 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TMEM165Q9HC07 324 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CHST7Q9NS84 486 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 SERPINF2P08697 491 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 FGFR2P21802 821 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GPR15P49685 360 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PTSQ03393 145 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BLMHQ13867 455 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TYSND1Q2T9J0 566 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TBCDQ9BTW9 1192 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 VAPBO95292 243 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 VCLP18206 1134 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ABATP80404 500 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 RFX4Q33E94 735 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 MIB1Q86YT6 1006 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 FBXO30Q8TB52 745 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 TCF12Q99081 682 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 RAB26Q9ULW5 256 aa15.85■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 BST1Q10588 318 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 C16orf62Q7Z3J2 963 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 SERAC1Q96JX3 654 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PRKAG3Q9UGI9 489 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 ERVK-10P10266 1014 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 MARC1Q5VT66 337 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 IL27RAQ6UWB1 636 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 LRRC19Q9H756 370 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CMTM6Q9NX76 183 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 GSC2O15499 205 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 CCNKO75909 580 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 STAG3L1P0CL83 205 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 FBXO32Q969P5 355 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 MED8Q96G25 268 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 PTPRHQ9HD43 1115 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 OOSP2Q86WS3 158 aa15.84■□□□□ 0.13
SH3BP2-207ENST00000503393 NAT14Q8WUY8 206 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms