RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496840.1

TARDBP-210, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene TARDBP, Length 692 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-210ENST00000496840 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 INSL5Q9Y5Q6 135 aa6.47□□□□□ -1.37
TARDBP-210ENST00000496840 C4orf47A7E2U8 309 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SPRY3O43610 288 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CYP1A2P05177 515 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CPA1P15085 419 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CHRNB2P17787 502 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TYK2P29597 1187 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 ENTPD1P49961 510 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 DUSP6Q16828 381 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 GXYLT1Q4G148 440 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TRIM31Q9BZY9 425 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 DCLK3Q9C098 648 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 MYO6Q9UM54 1294 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 RCE1Q9Y256 329 aa6.46□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 OR6C75A6NL08 312 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 LCATP04180 440 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 GSTM2P28161 218 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 ZP1P60852 638 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 PKP1Q13835 747 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 GPR18Q14330 331 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 BRD3Q15059 726 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 Q6ZTK2 550 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SAMD3Q8N6K7 520 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 KLHL31Q9H511 634 aa6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 BECN2A8MW95 431 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 RGS14O43566 566 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 MYZAPP0CAP1 466 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 UNGP13051 313 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CHN1P15882 459 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 PRKCHP24723 683 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 MCM2P49736 904 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 LTBQ06643 244 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 Q0VFX4 171 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 MORC3Q14149 939 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF585BQ52M93 769 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TRILQ7L0X0 811 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 GALNT7Q86SF2 657 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CADM3Q8N126 398 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 ELP5Q8TE02 316 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 HDAC7Q8WUI4 952 aa6.44□□□□□ -1.38
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TARDBP-210ENST00000496840 PHF21BQ96EK2 531 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 ZNF333Q96JL9 665 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CTAGE1Q96RT6 745 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa6.44□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 INAFM1C9JVW0 142 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 F5H423 210 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 H0Y3Z8 333 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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TARDBP-210ENST00000496840 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TGFB3P10600 412 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TRAF1Q13077 416 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 GPS2Q13227 327 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 AADACL2Q6P093 401 aa6.43□□□□□ -1.38
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TARDBP-210ENST00000496840 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 KCNJ9Q92806 393 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 KCND3Q9UK17 655 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 FZD10Q9ULW2 581 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 OSGIN2Q9Y236 505 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 EVPLQ92817 2033 aa6.43□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 MST1RQ04912 1400 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 STMND1H3BQB6 276 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 PLA2G2AP14555 144 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CST5P28325 142 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TNFRSF8P28908 595 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 RPS6KA3P51812 740 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 CCDC38Q502W7 563 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.42□□□□□ -1.38
TARDBP-210ENST00000496840 RRAGAQ7L523 313 aa6.42□□□□□ -1.38
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