RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488015.5

SRI-208, Transcript of sorcin, human

TSL 2

Gene SRI, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRI-208	ENST00000488015	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	GPR45	Q9Y5Y3	372 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CEP192	Q8TEP8	1941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ATM	Q13315	3056 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	KLHL33	A6NCF5	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015		I3L4J1	428 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ASAP2	O43150	1006 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	NRP2	O60462	931 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ABLIM3	O94929	683 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SEC24A	O95486	1093 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PRKCB	P05771	671 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TH	P07101	528 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	AGXT	P21549	392 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	MEOX1	P50221	254 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	EPHB1	P54762	984 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	RRAD	P55042	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	NPEPPS	P55786	919 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PTH1R	Q03431	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TWF1	Q12792	350 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	DMC1	Q14565	340 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ODF1	Q14990	250 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ACAP2	Q15057	778 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PTPA	Q15257	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ARID3B	Q8IVW6	561 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ZNF843	Q8N446	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TCP11	Q8WWU5	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	JADE3	Q92613	823 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CEP170P1	Q96L14	293 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	IL25	Q9H293	177 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	METTL14	Q9HCE5	456 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CEP72	Q9P209	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PTPRD	P23468	1912 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PTGES	O14684	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	B4GALT5	O43286	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PSMD10	O75832	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	B3GAT3	O94766	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	FSBP	O95073	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	EGF	P01133	1207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CFI	P05156	583 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	DRD1	P21728	446 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	BCKDHB	P21953	392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CIITA	P33076	1130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	MCM5	P33992	734 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	LIFR	P42702	1097 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	ABCG1	P45844	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SLC5A3	P53794	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	NRG3	P56975	720 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PTEN	P60484	403 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	PSMC5	P62195	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRI-208	ENST00000488015	CD69	Q07108	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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