RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 HIPK3Q9H422 1215 aa3.06□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CDH22Q9UJ99 828 aa3.06□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.06□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 NKX2-8O15522 239 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CRYAAP02489 173 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 IDEP14735 1019 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 PEX5P50542 639 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 FAM193AP78312 1265 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 DAG1Q14118 895 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 FCN2Q15485 313 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 AAK1Q2M2I8 961 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SLC30A9Q6PML9 568 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RASGRP3Q8IV61 690 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 ATP11CQ8NB49 1132 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 BICD1Q96G01 975 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 MMP28Q9H239 520 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SLC12A4Q9UP95 1085 aa3.05□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 AREL1O15033 823 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 TAF5LO75529 589 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CER1O95813 267 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 MYL4P12829 197 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 GRK5P34947 590 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 MYBPC2Q14324 1141 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 XKR9Q5GH70 373 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SORCS1Q8WY21 1168 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SNX27Q96L92 541 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.925e-16■□□□□ 8.2
SENP6-210ENST00000487548 LHPPQ9H008 270 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.04□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 MAGEA13PA6NCF6 341 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 POM121BA6NF01 834 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CLCA1A8K7I4 914 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 TMCC1O94876 653 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 SOX30O94993 753 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 UNGP13051 313 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 AZU1P20160 251 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 FGFR2P21802 821 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 KCNA5P22460 613 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 MXI1P50539 228 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CLCN3P51790 818 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 ADPRHP54922 357 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 NLRP5P59047 1200 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 ANAPC15P60006 121 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RPL15P61313 204 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RHAGQ02094 409 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 DLG1Q12959 904 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 PGBD5Q8N414 524 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 ZNF333Q96JL9 665 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 DUX3Q96PT4 197 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 EVA1AQ9H8M9 152 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 RAI2Q9Y5P3 530 aa3.03□□□□□ -1.92
SENP6-210ENST00000487548 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 OR2W5A6NFC9 320 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 RASA4BC9J798 803 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 KPNA5O15131 536 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 SLC22A3O75751 556 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 CLDN7O95471 211 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 ZBED1O96006 694 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 PDGFRBP09619 1106 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 IGFBP2P18065 325 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 EGR1P18146 543 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 FOXL2P58012 376 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 TLE3Q04726 772 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 GRM3Q14832 879 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 SLC1A5Q15758 541 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 FAM171A1Q5VUB5 890 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.02□□□□□ -1.93
SENP6-210ENST00000487548 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.6 ms