RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 NETO2Q8NC67 525 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MTMR14Q8NCE2 650 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF384Q8TF68 577 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SERAC1Q96JX3 654 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ASB8Q9H765 288 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 FSCN2O14926 492 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB14O43829 449 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PPM1AP35813 382 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CDK7P50613 346 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 BLVRAP53004 296 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 IL2P60568 153 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MAXP61244 160 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DOK6Q6PKX4 331 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MILR1Q7Z6M3 343 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 KYQ8NBH2 561 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TRPC4Q9UBN4 977 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 GPR25O00155 361 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DCXO43602 365 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SH3BGRLO75368 114 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF682O95780 498 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CATP04040 527 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SLC16A1P53985 500 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 USP45Q70EL2 814 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 FAM126BQ8IXS8 530 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CERS2Q96G23 380 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ARL15Q9NXU5 204 aa13.57□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM191CA6NGB0 347 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PIGNO95427 931 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PTPN4P29074 926 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PHKG1Q16816 387 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SLC24A5Q71RS6 500 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC8DQ7L1W4 858 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 RNF148Q8N7C7 305 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SPPL2BQ8TCT7 592 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 BTN2A2Q8WVV5 523 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PHF21AQ96BD5 680 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CPXM1Q96SM3 734 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 RXFP1Q9HBX9 757 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 AHSPQ9NZD4 102 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 NCANO14594 1321 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINB3P29508 390 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINB10P48595 397 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DRG2P55039 364 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PRKCQQ04759 706 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SCARA3Q6AZY7 606 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM154Q6P9G4 183 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 KRT78Q8N1N4 520 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 STK40Q8N2I9 435 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CLEC4DQ8WXI8 215 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TMCC3Q9ULS5 477 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CNTNAP1P78357 1384 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 APOA1P02647 267 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PTPN3P26045 913 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 POU1F1P28069 291 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB17Q13105 803 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MTSS1LQ765P7 747 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 LRRC49Q8IUZ0 686 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 MAML3Q96JK9 1138 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PCDHB18PQ96TA0 734 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TTPALQ9BTX7 342 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CATSPERZQ9NTU4 200 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC167Q9P0B6 97 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ARMCX1Q9P291 453 aa13.56□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 OR6C75A6NL08 312 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 SEC22BO75396 215 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TYMPP19971 482 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ADRA1BP35368 520 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 FLT3P36888 993 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 THOP1P52888 689 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 PRKAA2P54646 552 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 RUNX1T1Q06455 604 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 TGM3Q08188 693 aa13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
HDLBP-241ENST00000487169 GPSM1Q86YR5 675 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms