RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486621.1

TTC4-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 4, human

TSL 2

Gene TTC4, Length 549 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC4-204	ENST00000486621	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	DRC1	Q96MC2	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	PLAA	Q9Y263	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTC4-204	ENST00000486621		A1L4Q6	167 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ACKR2	O00590	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	YKT6	O15498	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZNF202	O95125	648 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LARGE1	O95461	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CYP17A1	P05093	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ACADM	P11310	421 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KCNE1	P15382	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GNA11	P29992	359 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PDE6C	P51160	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TPMT	P51580	245 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	GAD2	Q05329	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ADAM9	Q13443	819 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KCNB1	Q14721	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TBR1	Q16650	682 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621		Q4G0T1	1027 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLC22A12	Q96S37	553 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TM9SF3	Q9HD45	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	UBP1	Q9NZI7	540 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DEC1	Q9P2X7	70 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	KCNJ18	B7U540	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621		E7EWF7	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	HIP1	O00291	1037 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	LEFTY2	O00292	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	VPS4B	O75351	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	DDAH2	O95865	285 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	CYP21A2	P08686	494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	PDE1A	P54750	535 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ANTXR2	P58335	489 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	OSTN	P61366	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	MORC3	Q14149	939 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC4-204	ENST00000486621	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.89	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms