RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PCM1Q15154 2024 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 A6NL46 340 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PPEF2O14830 753 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa7.86□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 CHN2P52757 468 aa7.86□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NATD1Q8N6N6 113 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 LSMEM1Q8N8F7 131 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 OR6Y1Q8NGX8 325 aa7.86□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 EPS15L1Q9UBC2 864 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MOSPD1Q9UJG1 213 aa7.86□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.86□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 F8W810 466 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TMCC2O75069 709 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 OLFM2O95897 454 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TFAP2AP05549 437 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 CHRNA3P32297 505 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 AP2B1P63010 937 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 XIAPP98170 497 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 UGT2A3Q6UWM9 527 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 NSL1Q96IY1 281 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 C8orf48Q96LL4 319 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SDCBP2Q9H190 292 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 MAN1C1Q9NR34 630 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 ANHXE9PGG2 379 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 CILPO75339 1184 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 GUCY1B2O75343 617 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 CBWD5Q5RIA9 395 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 KRT39Q6A163 491 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 SEMA4DQ92854 862 aa7.85□□□□□ -1.15
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USP4-211ENST00000485450 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SZT2Q5T011 3432 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 TNFRSF10BO14763 440 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 SGTAO43765 313 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 FOSL1P15407 271 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 ANXA13P27216 316 aa7.85□□□□□ -1.15
USP4-211ENST00000485450 IRS1P35568 1242 aa7.85□□□□□ -1.15
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