RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484281.1

RAB18-205, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB18, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-205	ENST00000484281	USP44	Q9H0E7	712 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	FNIP2	Q9P278	1114 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ESPL1	Q14674	2120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281		B4DLN1	442 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	AP5Z1	O43299	807 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	AHCYL1	O43865	530 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	OPA1	O60313	960 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CDC14B	O60729	498 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	RAMP2	O60895	175 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	VPS4B	O75351	444 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ERLIN1	O75477	346 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	MYL1	P05976	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	PYGL	P06737	847 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ACRV1	P26436	265 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	FLT3	P36888	993 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	GRK6	P43250	576 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TRPC1	P48995	793 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TGIF1	Q15583	401 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CRY1	Q16526	586 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	IQCA1	Q86XH1	822 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	BTN2A2	Q8WVV5	523 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SAAL1	Q96ER3	474 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	PNMA2	Q9UL42	364 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SMIM35	A0A1B0GVV1	85 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SLC27A2	O14975	620 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	GPR32	O75388	356 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	PRDM1	O75626	825 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CER1	O95813	267 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TTLL1	O95922	423 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	IGHD	P01880	384 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TUBB4A	P04350	444 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ITGAV	P06756	1048 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC175	P0C221	793 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	LCP1	P13796	627 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ZNF24	P17028	368 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TEAD2	Q15562	447 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RAB18-205	ENST00000484281	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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