RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FSCBQ5H9T9 825 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 HYIQ5T013 277 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TMTC4Q5T4D3 741 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 LPCAT4Q643R3 524 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 KRT39Q6A163 491 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 KRT80Q6KB66 452 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM122CQ6P4D5 195 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM171BQ6P995 826 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 C16orf89Q6UX73 402 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RNF111Q6ZNA4 994 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ALG3Q92685 438 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CCDC127Q96BQ5 260 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NRBF2Q96F24 287 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GCNAQ96QF7 691 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CYTH2Q99418 400 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RTKNQ9BST9 563 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PBX4Q9BYU1 374 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NMUR2Q9GZQ4 415 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 COA1Q9GZY4 146 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CLPBQ9H078 707 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PDZD7Q9H5P4 517 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SLA2Q9H6Q3 261 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MLXIPLQ9NP71 852 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GDAP2Q9NXN4 497 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 OBP2AQ9NY56 170 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GPRC5DQ9NZD1 345 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RIMS3Q9UJD0 308 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GRID1Q9ULK0 1009 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CAPN8A6NHC0 703 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 YDJCA8MPS7 323 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GABRDO14764 452 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TNFRSF10CO14798 259 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DYRK3O43781 588 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 UGT2B4P06133 528 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NAT2P11245 290 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CETPP11597 493 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V1B1P15313 513 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ITIH1P19827 911 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NFKB1P19838 968 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 IMPDH1P20839 514 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TNFAIP3P21580 790 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 TGM1P22735 817 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 IL12AP29459 219 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RRM2P31350 389 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PHKA1P46020 1223 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DGKGP49619 791 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 IST1P53990 364 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PCDH1Q08174 1060 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SELENBP1Q13228 472 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 DUSP7Q16829 419 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SV2CQ496J9 727 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 C5orf22Q49AR2 442 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 USP43Q70EL4 1123 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 GALNT13Q8IUC8 556 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 CADM3Q8N126 398 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BEST2Q8NFU1 509 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 BSNDQ8WZ55 320 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 RAD54LQ92698 747 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 SHISA4Q96DD7 197 aa7.3□□□□□ -1.24
PKP4-211ENST00000481115 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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