RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ZNF292O60281 2723 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 GON4LQ3T8J9 2241 aa21.45■■□□□ 1.03
ACTB-211ENST00000480301 CREB3O43889 395 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ZNF806P0C7X5 589 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 EPHB2P29323 1055 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PCK1P35558 622 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ACAP1Q15027 740 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 BTBD6Q96KE9 485 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 DEF6Q9H4E7 631 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 WASH4PA8MWX3 477 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CBX4O00257 560 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 AKR1B10O60218 316 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PRPSAP2O60256 369 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 NDUFS2O75306 463 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 DNTTP04053 509 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ACVRL1P37023 503 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ACCSLQ4AC99 568 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 LINGO4Q6UY18 593 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TC2NQ8N9U0 490 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 MAGEH1Q9H213 219 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SMOC1Q9H4F8 434 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 K7ERQ8 282 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TCF4P15884 667 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 IL1R2P27930 398 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 HTR7P34969 479 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ARF5P84085 180 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ZNF33AQ06730 810 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CST6Q15828 149 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 LYSMD4Q5XG99 296 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 IL31Q6EBC2 164 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PRR23CQ6ZRP0 262 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CYP2U1Q7Z449 544 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 FAM124AQ86V42 546 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 NIPA2Q8N8Q9 360 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ATP11CQ8NB49 1132 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PIGKQ92643 395 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CCDC42Q96M95 316 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 VPS45Q9NRW7 570 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TMEM74BQ9NUR3 256 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 IP6K2Q9UHH9 426 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.43■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 RAMP2O60895 175 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CD160O95971 181 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 H2AFZP0C0S5 128 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ITPKAP23677 461 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ETFBP38117 255 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CLCN6P51797 869 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SLC20A2Q08357 652 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 RETSATQ6NUM9 610 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 Q6ZVU0 165 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 H2AFVQ71UI9 128 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 GPR174Q9BXC1 333 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SCML1Q9UN30 329 aa21.42■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 MYO1FO00160 1098 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 MID1O15344 667 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TMEM253P0C7T8 217 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SLC8A1P32418 973 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 ACSL1P33121 698 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 TPI1P60174 286 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 USP30Q70CQ3 517 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 SYT12Q8IV01 421 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 OR8D1Q8WZ84 308 aa21.41■■□□□ 1.02
ACTB-211ENST00000480301 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms