RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 SPON2Q9BUD6 331 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 PDFQ9HBH1 243 aa20.4■□□□□ 0.86
ACTB-210ENST00000477812 KDELR3O43731 214 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RNF40O75150 1001 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CD160O95971 181 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ASLP04424 464 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TGM2P21980 687 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CXCR5P32302 372 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 VASPP50552 380 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 DYNLT1P63172 113 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SULT2A1Q06520 285 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LRRC32Q14392 662 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 GAS6Q14393 721 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 IL31Q6EBC2 164 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NPNTQ6UXI9 565 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SYNPOQ8N3V7 929 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LMAN1LQ9HAT1 526 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SNX12Q9UMY4 172 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 HS3ST2Q9Y278 367 aa20.39■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ARHGAP42A6NI28 874 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CBX4O00257 560 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PRAMEF11O60813 436 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MAP3K6O95382 1288 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 STK19P49842 368 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SEC13P55735 322 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ECT2LQ008S8 904 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PKN3Q6P5Z2 889 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZSCAN30Q86W11 494 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 FLCNQ8NFG4 579 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ACOX2Q99424 681 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TMEM245Q9H330 911 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MFSD1Q9H3U5 465 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 C11orf16Q9NQ32 467 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SIT1Q9Y3P8 196 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RAD54BQ9Y620 910 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 J3KR12 359 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 DFFAO00273 331 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MAFKO60675 156 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TJP3O95049 919 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PEX11BO96011 259 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 MT-CO1P00395 513 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 APOC2P02655 101 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CETN2P41208 172 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 GARSP41250 739 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RPS9P46781 194 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NR2C2P49116 596 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF234Q14588 700 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LINGO4Q6UY18 593 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 LRRC49Q8IUZ0 686 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 KDM1BQ8NB78 822 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 UCMAQ8WVF2 138 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CHRDQ9H2X0 955 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 HEY1Q9Y5J3 304 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ACTL7AQ9Y615 435 aa20.37■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 NPC1O15118 1278 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 PI15O43692 258 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ADAM23O75077 832 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 AOC1P19801 751 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 TIE1P35590 1138 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 IL12RB1P42701 662 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CLCN5P51795 746 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 C2orf27AQ580R0 203 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 RASGEF1CQ8N431 466 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ATPAF2Q8N5M1 289 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 ALLCQ8N6M5 410 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 CCDC26Q8TAB7 109 aa20.36■□□□□ 0.85
ACTB-210ENST00000477812 COG1Q8WTW3 980 aa20.36■□□□□ 0.85
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