RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477099.1

AC079910.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC079910.1, Length 749 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC079910.1-201ENST00000477099 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PAG1Q9NWQ8 432 aa5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 RIMKLBQ9ULI2 386 aa5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FAM50BQ9Y247 325 aa5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 AQP7P3A6NL99 342 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 RHPN2P1A8MT19 583 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PPP6CO00743 305 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PRDM1O75626 825 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ASNSP08243 561 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 KELP23276 732 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CERS1P27544 350 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 HOXD10P28358 340 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ADD2P35612 726 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 UBXN2AP68543 259 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ARHGEF6Q15052 776 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FAM110CQ1W6H9 321 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 MTX3Q5HYI7 312 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 MANEALQ5VSG8 457 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 RRAGBQ5VZM2 374 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ZNF626Q68DY1 528 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 USP49Q70CQ1 688 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 GPR142Q7Z601 462 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 NEK8Q86SG6 692 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 METTL25Q8N6Q8 603 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 KIF1BPQ96EK5 621 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ZNF778Q96MU6 729 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SEMA4CQ9C0C4 833 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PDGFCQ9NRA1 345 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 RNF7Q9UBF6 113 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 GJD2Q9UKL4 321 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CAPN11Q9UMQ6 739 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 HPSEQ9Y251 543 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 LTBP2Q14767 1821 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 COL6A3P12111 3177 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PFASO15067 1338 aa5.2□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 LCTP09848 1927 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 M0R3H8 397 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 INMTO95050 263 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 IL18RAPO95256 599 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SGPL1O95470 568 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 MT-CO3P00414 261 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 TUBB4AP04350 444 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 MCM5P33992 734 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 COPB1P53618 953 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SNAP25P60880 206 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 DEUP1Q05D60 604 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 GABPAQ06546 454 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 DAG1Q14118 895 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FAM187BQ17R55 369 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 AWAT1Q58HT5 328 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SLC18B1Q6NT16 456 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 TATDN1Q6P1N9 297 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 Q7L0L9 218 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 RNF44Q7L0R7 432 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SKAP1Q86WV1 359 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 TRPV1Q8NER1 839 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ANP32EQ9BTT0 268 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 VPS51Q9UID3 782 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa5.19□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 EYSQ5T1H1 3165 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 KPNA5O15131 536 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 HMMRO75330 724 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FLOT1O75955 427 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PGK2P07205 417 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 PRMT2P55345 433 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ICA1Q05084 483 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 ZNF543Q08ER8 600 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FHL3Q13643 280 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 LRRC26Q2I0M4 334 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 FAM83BQ5T0W9 1011 aa5.18□□□□□ -1.58
AC079910.1-201ENST00000477099 CTR9Q6PD62 1173 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms