RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453923.1

DDX39BP2-208, Transcript of DEAD-box helicase 39B pseudogene 2, human

BASIC

Gene DDX39BP2, Length 258 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX39BP2-208	ENST00000453923	LILRA4	P59901	499 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FMO1	Q01740	532 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SPAG1	Q07617	926 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FOXI1	Q12951	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PPIL2	Q13356	520 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MPP3	Q13368	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CUL4B	Q13620	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CEP55	Q53EZ4	464 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	VWA1	Q6PCB0	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MPP5	Q8N3R9	675 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RAD54L	Q92698	747 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RIT2	Q99578	217 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TRIM9	Q9C026	710 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ACAD9	Q9H845	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SACM1L	Q9NTJ5	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RNF146	Q9NTX7	359 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.98	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PFAS	O15067	1338 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	WDR81	Q562E7	1941 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	IGLV3-22	A0A075B6J6	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923		A0A087WWV3	80 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	YY2	O15391	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MSH4	O15457	936 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PEX1	O43933	1283 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RAMP2	O60895	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CAND2	O75155	1236 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PSMD10	O75832	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FGFR1OP	O95684	399 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TPM2	P07951	284 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CYP2C9	P11712	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MPL	P40238	635 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	GSDMD	P57764	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FKBP1B	P68106	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	SPATA1	Q5VX52	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	STAM	Q92783	540 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	CDHR1	Q96JP9	859 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	PLIN2	Q99541	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TOR3A	Q9H497	397 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDX39BP2-208	ENST00000453923	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms