RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452495.1

TRAPPC12-211, Transcript of trafficking protein particle complex 12, humanhuman

TSL 4

Gene TRAPPC12, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12-211ENST00000452495 TFDP3Q5H9I0 405 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 EOGTQ5NDL2 527 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 IL31Q6EBC2 164 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SDE2Q6IQ49 451 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 RETSATQ6NUM9 610 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SYT13Q7L8C5 426 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CCDC50Q8IVM0 306 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CHPFQ8IZ52 775 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ALLCQ8N6M5 410 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 IL17RCQ8NAC3 791 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SORCS1Q8WY21 1168 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 RNF157Q96PX1 679 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 GABRG3Q99928 467 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 KCND1Q9NSA2 647 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 VPS51Q9UID3 782 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 HCN2Q9UL51 889 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ERVW-1Q9UQF0 538 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 HS3ST2Q9Y278 367 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 EML5Q05BV3 1969 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CBX4O00257 560 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 APOL1O14791 398 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 KDELR3O43731 214 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 KIF5CO60282 957 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ACVRL1P37023 503 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 NNMTP40261 264 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CETN2P41208 172 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CCR3P51677 355 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CLCN6P51797 869 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 NUBP1P53384 320 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SERINC3Q13530 473 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 GAS6Q14393 721 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 HS1BP3Q53T59 392 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MEI1Q5TIA1 1274 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MFSD7Q6UXD7 560 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 RFX6Q8HWS3 928 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 PQLC3Q8N755 202 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ALG3Q92685 438 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 HMCESQ96FZ2 354 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SPON2Q9BUD6 331 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 TMEM245Q9H330 911 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 EFR3BQ9Y2G0 817 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 RAD54BQ9Y620 910 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 STON1Q9Y6Q2 735 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 USP27XA6NNY8 438 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MFSD11O43934 449 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SNAP91O60641 907 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZMPSTE24O75844 475 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 HOXB2P14652 356 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 AVPR2P30518 371 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 IL12RB1P42701 662 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ARF5P84085 180 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SLC20A2Q08357 652 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MTAPQ13126 283 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 EMC10Q5UCC4 262 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SH2D3CQ8N5H7 860 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 PLD5Q8N7P1 536 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 MYO19Q96H55 970 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC12-211ENST00000452495 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 SGK1O00141 431 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 ATP9BO43861 1147 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 ADAM23O75077 832 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 MX2P20592 715 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 TGM2P21980 687 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 PRKCHP24723 683 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 GALNT2Q10471 571 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 STARD3Q14849 445 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC12-211ENST00000452495 RPS6KA1Q15418 735 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms