RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449704.5

TOP3B-211, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 543 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-211ENST00000449704 BCKDHBP21953 392 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 FECHP22830 423 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DLG2Q15700 870 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ELF2Q15723 593 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 MAP7D1Q3KQU3 841 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 PLK5Q496M5 336 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RETSATQ6NUM9 610 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RFX8Q6ZV50 586 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 TEKT4Q8WW24 435 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 FBRSQ9HAH7 460 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 NCDNQ9UBB6 729 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SDK1Q7Z5N4 2213 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 WASH4PA8MWX3 477 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 H3BRJ5 948 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 K7ERQ8 282 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ATP9BO43861 1147 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RHOBTB1O94844 696 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 NDUFA10O95299 355 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 LCA5LO95447 670 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SRCP12931 536 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ARL4AP40617 200 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 KRT81Q14533 505 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 C11orf74Q86VG3 221 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 STK40Q8N2I9 435 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 FRS2Q8WU20 508 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 PTPRN2Q92932 1015 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 CD93Q9NPY3 652 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DONSONQ9NYP3 566 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 TFR2Q9UP52 801 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 HS3ST2Q9Y278 367 aa16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 VPS13AQ96RL7 3174 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RASA4BC9J798 803 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RASA4O43374 803 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ZMPSTE24O75844 475 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 MTA2O94776 668 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DNTTP04053 509 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ERCC2P18074 760 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 MAN1A1P33908 653 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ARHGAP25P42331 645 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SLC20A2Q08357 652 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DPYSL2Q16555 572 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RAD9BQ6WBX8 426 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 Q6ZVU0 165 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DEFB119Q8N690 84 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 GANCQ8TET4 914 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 HMCESQ96FZ2 354 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 FAM129BQ96TA1 746 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ITM2CQ9NQX7 267 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.06■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 PSMD8P48556 350 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 HCAR3P49019 387 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DNA2P51530 1060 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 TPMTP51580 245 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 CLCN6P51797 869 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 CDH6P55285 790 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 TAS2R40P59535 323 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 ARF5P84085 180 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 DPYSQ14117 519 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 PARP15Q460N3 678 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 SLC36A4Q6YBV0 504 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 LPCAT2Q7L5N7 544 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 POLNQ7Z5Q5 900 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 FAM124AQ86V42 546 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 TMEFF1Q8IYR6 380 aa16.05■□□□□ 0.16
TOP3B-211ENST00000449704 NETO2Q8NC67 525 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms