RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 GATAD2AQ86YP4 633 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FIBINQ8TAL6 211 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 STK32AQ8WU08 396 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 FGF11Q92914 225 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TTC17Q96AE7 1141 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TRIM62Q9BVG3 475 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SLC4A5Q9BY07 1137 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PRORYQ9H606 182 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 SIK3Q9Y2K2 1263 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa12.03□□□□□ -0.48
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PP55 124 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TLR4O00206 839 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ACSL4O60488 711 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SIN3BO75182 1162 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ERBB2P04626 1255 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MMEP08473 750 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 GOT1P17174 413 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CKMT2P17540 419 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 C5AR1P21730 350 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CD70P32970 193 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SOX5P35711 763 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 RXRGP48443 463 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CLDN6P56747 220 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TBX4P57082 545 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SNX16P57768 344 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CCDC173Q0VFZ6 552 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 NNTQ13423 1086 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TAF5Q15542 800 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 PTPN20Q4JDL3 420 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 BROXQ5VW32 411 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MSANTD2Q6P1R3 559 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 DSG4Q86SJ6 1040 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TMEM110Q86TL2 294 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 IQCHQ86VS3 1027 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 VSTM4Q8IW00 320 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 WDTC1Q8N5D0 677 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 EID2Q8N6I1 236 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TMEM35BQ8NCS4 154 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SLC20A1Q8WUM9 679 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SERAC1Q96JX3 654 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SERPINB11Q96P15 392 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 PPP1R9BQ96SB3 815 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ORAI3Q9BRQ5 295 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 FAM204AQ9H8W3 233 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 POPDC2Q9HBU9 364 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CLCA2Q9UQC9 943 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 DMTF1Q9Y222 760 aa12.02□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PQC6 194 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 GOLGA8SH3BPF8 625 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MID1O15344 667 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SLC7A4O43246 635 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SLC8A1P32418 973 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 PBX1P40424 430 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CSKP41240 450 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 RPL34P49207 117 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 OXCT1P55809 520 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 NXPH1P58417 271 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SULT2A1Q06520 285 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC3Q13217 504 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 C2CD6Q53TS8 623 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 DCAF6Q58WW2 860 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 SYPL2Q5VXT5 272 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 NAA35Q5VZE5 725 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 FBXL19Q6PCT2 694 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TAC4Q86UU9 113 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 LSMEM2Q8N112 164 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CARNMT1Q8N4J0 409 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MFSD2AQ8NA29 543 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 MSANTD4Q8NCY6 345 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 OR14C36Q8NHC7 312 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 EPS8L1Q8TE68 723 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 CPA5Q8WXQ8 436 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 RFFLQ8WZ73 363 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 RNF34Q969K3 372 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 ERGIC2Q96RQ1 377 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 NEUROG2Q9H2A3 272 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 STIM2Q9P246 746 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 RAI2Q9Y5P3 530 aa12.01□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 PLXNA2O75051 1894 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D3EA0A087X179 549 aa12□□□□□ -0.49
PRAME-210ENST00000442481 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms