RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 VIPR2P41587 438 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GPR158Q5T848 1215 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PMS2CLQ68D20 193 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FUT10Q6P4F1 479 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RTL10Q7L3V2 364 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PLXDC1Q8IUK5 500 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GALNT15Q8N3T1 639 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MARCH5Q9NX47 278 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRK-211ENST00000429595 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SPTA1P02549 2419 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 UNC119BA6NIH7 251 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CHADO15335 359 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SH3BP5O60239 455 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NRP2O60462 931 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM127O75204 238 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MX1P20591 662 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 FCARP24071 287 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CHMLP26374 656 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GPC3P51654 580 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SEC24CP53992 1094 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CXADRP78310 365 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 APBA1Q02410 837 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GRM4Q14833 912 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PSMD5Q16401 504 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 METRNLQ641Q3 311 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PASD1Q8IV76 773 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 COLGALT2Q8IYK4 626 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ELMOD1Q8N336 334 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CNNM3Q8NE01 707 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CEP76Q8TAP6 659 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 EXOC4Q96A65 974 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 WBP1Q96G27 269 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PIGSQ96S52 555 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GAD1Q99259 594 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 GPR88Q9GZN0 384 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ANKMY1Q9P2S6 941 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 COX11Q9Y6N1 276 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NFASCO94856 1347 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MARCH11A6NNE9 402 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PRRG1O14668 218 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 BAG4O95429 457 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HLA-EP13747 358 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NEK4P51957 841 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 HAND2P61296 217 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PHC1P78364 1004 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RHDQ02161 417 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SLC14A1Q13336 389 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SLC5A9Q2M3M2 681 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 VPS53Q5VIR6 699 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ABHD15Q6UXT9 468 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TTC30AQ86WT1 665 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 LRRC71Q8N4P6 559 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TSTD1Q8NFU3 115 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 ASB10Q8WXI3 467 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PIBF1Q8WXW3 757 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NEU1Q99519 415 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 CLSTN3Q9BQT9 956 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 NRBP2Q9NSY0 501 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-211ENST00000429595 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.75□□□□□ -1.33
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