RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FSBPO95073 299 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA4FO95754 770 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZBED1O96006 694 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 WNT1P04628 370 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A4P31645 630 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CTSKP43235 329 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GRIA4P48058 902 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CBWD6Q4V339 395 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MPPE1Q53F39 396 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CBWD3Q5JTY5 395 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CBWD5Q5RIA9 395 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 BSPRYQ5W0U4 402 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MBLAC2Q68D91 279 aa6.81□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 DHRS13Q6UX07 377 aa6.81□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.81□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.81□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 RAB20Q9NX57 234 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GGA2Q9UJY4 613 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ACACAQ13085 2346 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TNFSF14O43557 240 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 URB1O60287 2271 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHGA12O60330 932 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CALCAP01258 141 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PRNPP04156 253 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CMA1P23946 247 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CD27P26842 260 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GTF2H1P32780 548 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFA8P51970 172 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ENPEPQ07075 957 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ADIGQ0VDE8 80 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC157Q569K6 752 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KRT39Q6A163 491 aa6.8□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.8□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CLEC4CQ8WTT0 213 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TFAP2BQ92481 460 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 IGSF8Q969P0 613 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SNX21Q969T3 373 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MRGPRX3Q96LB0 322 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 SLC6A18Q96N87 628 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 A0A087WV48 116 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1B0GTQ1 180 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 O00370 1275 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PLK4O00444 970 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TBL1XO60907 577 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV3-27P01718 113 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 PRB1P04280 392 aa6.79□□□□□ -1.32
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HOXD8-202ENST00000429017 KRT13P13646 458 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ITPKBP27987 946 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GRK6P43250 576 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 HARS2P49590 506 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 RGS7P49802 495 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 MXI1P50539 228 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 CCT8P50990 548 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 GALCP54803 685 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 DAOAP59103 153 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ARID5AQ03989 594 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KCNJ12Q14500 433 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 FSCBQ5H9T9 825 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 ADGRF1Q5T601 910 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.79□□□□□ -1.32
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