RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 CHP1Q99653 195 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PACSIN1Q9BY11 444 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 VPS45Q9NRW7 570 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PILRBQ9UKJ0 227 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SARDHQ9UL12 918 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 NUP205Q92621 2012 aa11.01□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ANKRD62A6NC57 917 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PLK4O00444 970 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CREB3O43889 395 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 LRCH4O75427 683 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 TPM3P06753 285 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CTSLP07711 333 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ACADMP11310 421 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 IL1R2P27930 398 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MIPP30301 263 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 L1CAMP32004 1257 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PSMD8P48556 350 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 IRX4P78413 519 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 GNA12Q03113 381 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 LMNB2Q03252 620 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CST6Q15828 149 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC122Q5T0U0 273 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SARM1Q6SZW1 724 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 Q6ZVU0 165 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 DCAF4L2Q8NA75 395 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 OR8K1Q8NGG5 319 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 FNIP1Q8TF40 1166 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 VOPP1Q96AW1 172 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SPON2Q9BUD6 331 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 KLC2Q9H0B6 622 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ABHD10Q9NUJ1 306 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 DLL3Q9NYJ7 618 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A13Q9UJS0 675 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 HS3ST2Q9Y278 367 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa11□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1W2PP55 124 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 LNP1A1A4G5 178 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf142B7Z368 130 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CBX4O00257 560 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MFAP3LO75121 409 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 NDUFS2O75306 463 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 DNTTP04053 509 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CYP1A2P05177 515 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MYBL1P10243 752 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 OXTRP30559 389 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SLC8A1P32418 973 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 DRD3P35462 400 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ID4P47928 161 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MAPKAPK2P49137 400 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 GALCP54803 685 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ZBTB16Q05516 673 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 POM121L1PQ3SYA9 428 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ACCSLQ4AC99 568 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 EFHC2Q5JST6 749 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF783Q6ZMS7 281 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 LEKR1Q6ZMV7 388 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SYT12Q8IV01 421 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ATP11CQ8NB49 1132 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 NETO2Q8NC67 525 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CHST14Q8NCH0 376 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 OR2A12Q8NGT7 310 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ORAI3Q9BRQ5 295 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 NUP85Q9BW27 656 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 NEUROG2Q9H2A3 272 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 TNKS2Q9H2K2 1166 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 FBRSQ9HAH7 460 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ATP13A1Q9HD20 1204 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 FBXL12Q9NXK8 326 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 AP4E1Q9UPM8 1137 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SCINQ9Y6U3 715 aa10.99□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CEP192Q8TEP8 1941 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CHD5Q8TDI0 1954 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 METTL12A8MUP2 240 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 WASH4PA8MWX3 477 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 BNIP3LO60238 219 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 IL1BP01584 269 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 EPHB2P29323 1055 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 NNMTP40261 264 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 AIF1P55008 147 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 KRT83P78385 493 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 TRIM14Q14142 442 aa10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
ATG4B-210ENST00000428861 SLC18A3Q16572 532 aa10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms