RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424265.5

USP54-205, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 2

Gene USP54, Length 5,201 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-205ENST00000424265 DPYSQ14117 519 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 LONRF1Q17RB8 773 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 OGFOD2Q6N063 350 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SCYL2Q6P3W7 929 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 UNC93B1Q9H1C4 597 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PADI3Q9ULW8 664 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FAM25AB3EWG3 89 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FAM25CB3EWG5 89 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FAM25GB3EWG6 89 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 H3BRJ5 948 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PODXLO00592 558 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PHF2O75151 1096 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 USP1O94782 785 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PSMA2P25787 234 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TMED2Q15363 201 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SGCDQ92629 289 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 DIABLOQ9NR28 239 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 KCTD5Q9NXV2 234 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 IPPQ9Y573 584 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 A8MX80 341 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 H0YGN5 161 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 CDK2AP1O14519 115 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 VILLO15195 856 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 GSC2O15499 205 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZNF254O75437 659 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 MAP3K6O95382 1288 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 GM2AP17900 193 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FECHP22830 423 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 MYL6P60660 151 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 COPZ1P61923 177 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PERM1Q5SV97 790 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SERINC5Q86VE9 423 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 DAW1Q8N136 415 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TOP6BLQ8N6T0 577 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FAR2Q96K12 515 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZNF558Q96NG5 402 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SNX24Q9Y343 169 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 NFS1Q9Y697 457 aa9.99□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 KLHL2O95198 593 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ACSL3O95573 720 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 S100A6P06703 90 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 LAG3P18627 525 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 EVI2BP34910 448 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TUSC3Q13454 348 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TFDP2Q14188 446 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SCARA3Q6AZY7 606 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TTC13Q8NBP0 860 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TMEM176AQ96HP8 235 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 WNT8AQ9H1J5 351 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 C12orf10Q9HB07 376 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TMEM5Q9Y2B1 443 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FAM172BPA6NC97 362 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 C16orf96A6NNT2 1141 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 KPNA7A9QM74 516 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 PBX1P40424 430 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 GPD2P43304 727 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 DSC3Q14574 896 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 GLYCTKQ8IVS8 523 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 B3GALT6Q96L58 329 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 A0A0B4J203 849 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 MUSKO15146 869 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SGPL1O95470 568 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ADORA2BP29275 332 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZFPM2Q8WW38 1151 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 TRIM51Q9BSJ1 452 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 C1orf50Q9BV19 199 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 CISHQ9NSE2 258 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.813e-9■■■■■ 206.8
USP54-205ENST00000424265 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 STMND1H3BQB6 276 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 ADRB2P07550 413 aa9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
USP54-205ENST00000424265 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.3 ms