RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055		Q6ZS52	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DEFB124	Q8NES8	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NCOA7	Q8NI08	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	WDR48	Q8TAF3	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SCOC	Q9UIL1	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	KLK13	Q9UKR3	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HES2	Q9Y543	173 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	COL4A2	P08572	1712 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CIT	O14578	2027 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SMCO2	A6NFE2	343 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055		E7EWF7	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PRRG1	O14668	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ADAM12	O43184	909 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	OPHN1	O60890	802 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PHF2	O75151	1096 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	C1R	P00736	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CEACAM1	P13688	526 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PTPN2	P17706	415 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PSMC3	P17980	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SMARCA1	P28370	1054 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HOXA9	P31269	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	ELF1	P32519	619 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	OR1D2	P34982	312 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SREBF1	P36956	1147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	VIPR2	P41587	438 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	GLRB	P48167	497 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PON2	Q15165	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MAN2A1	Q16706	1144 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	FAM78A	Q5JUQ0	283 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TICAM2	Q86XR7	235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	PPM1N	Q8N819	430 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	APIP	Q96GX9	242 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CPB2	Q96IY4	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MBOAT7	Q96N66	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MTG2	Q9H4K7	406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	MIOS	Q9NXC5	875 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PTPRK-210	ENST00000415055	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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