RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410983.1

RNU6-564P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 564, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-564P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-564P-201ENST00000410983 TBC1D29Q9UFV1 150 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-564P-201ENST00000410983 MAFFQ9ULX9 164 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-564P-201ENST00000410983 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.28□□□□□ -1.4
RNU6-564P-201ENST00000410983 OR6C68A6NDL8 312 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CEP104O60308 925 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMCC2O75069 709 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CD72P21854 359 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 NFKBIAP25963 317 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 BSGP35613 385 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 RAD52P43351 418 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SOX10P56693 466 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 AWAT1Q58HT5 328 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 GHDCQ8N2G8 530 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CPXM2Q8N436 756 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CAGE1Q8TC20 777 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 USP6NLQ92738 828 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 REPS1Q96D71 796 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 KLHL15Q96M94 604 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SYNCQ9H7C4 482 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 DHDHQ9UQ10 334 aa6.27□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 A0A1W2PQM1 296 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMEM247A6NEH6 219 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TGFB1I1O43294 461 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 HOXD13P35453 343 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CPA2P48052 419 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZBTB16Q05516 673 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CUL4AQ13619 759 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 FBXO43Q4G163 708 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 KLBQ86Z14 1044 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 OR8H2Q8N162 312 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SCAIQ8N9R8 606 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 KLHL29Q96CT2 875 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SERINC2Q96SA4 455 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 MUC13Q9H3R2 512 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ERVK-5Q9HDB9 667 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 Q9N2J8 555 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TNFSF13BQ9Y275 285 aa6.26□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 KCNJ18B7U540 433 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 MGST3O14880 152 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 AHCYL1O43865 530 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SEC14L2O76054 403 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CBX6O95503 412 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 MLYCDO95822 493 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 FCGR2AP12318 317 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 MCM7P33993 719 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 PTPN9P43378 593 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 SOX2P48431 317 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 RHAGQ02094 409 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 RILPL1Q5EBL4 403 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF667Q5HYK9 610 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 C17orf99Q6UX52 265 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 IKBIPQ70UQ0 350 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 NEK8Q86SG6 692 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 FAM47BQ8NA70 645 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 C11orf65Q8NCR3 313 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 KAT2BQ92831 832 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TIMP4Q99727 224 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 PIP5K1AQ99755 562 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TOR3AQ9H497 397 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 CPNE5Q9HCH3 593 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.25□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TARM1B6A8C7 271 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 RRHO14718 337 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 TACR3P29371 465 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-564P-201ENST00000410983 ICAM3P32942 547 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms