RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384606.1

RNU6-658P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 658, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-658P, Length 106 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-658P-201ENST00000384606 C11orf65Q8NCR3 313 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 RUFY2Q8WXA3 655 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 KCNJ9Q92806 393 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 KLHL29Q96CT2 875 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 KIF1BPQ96EK5 621 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC34Q96HJ3 373 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 FRG2BQ96QU4 278 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ITPAQ9BY32 194 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CIPCQ9C0C6 399 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CTDSP1Q9GZU7 261 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 HAUS2Q9NVX0 235 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TBC1D29Q9UFV1 150 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 LINC00473A8K010 186 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 B4DLN1 442 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CLIC1O00299 241 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 AP3D1O14617 1153 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 DSCR3O14972 297 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 PLOD3O60568 738 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 URODP06132 367 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ADH4P08319 380 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 LYL1P12980 280 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 AVPR2P30518 371 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CPOXP36551 454 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 COPB1P53618 953 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 UFM1P61960 85 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 NEXNQ0ZGT2 675 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 EPS8Q12929 822 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 GAB1Q13480 694 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC18A3Q16572 532 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CCDC142Q17RM4 750 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 FAM153CQ494X1 144 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 MTFR2Q6P444 385 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMEM65Q6PI78 240 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 NCEH1Q6PIU2 408 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 SARM1Q6SZW1 724 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 Q6YL49 198 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 RTL10Q7L3V2 364 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 NEK8Q86SG6 692 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMEM200AQ86VY9 491 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMTC2Q8N394 836 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 EXD3Q8N9H8 876 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ZFPM2Q8WW38 1151 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 USP6NLQ92738 828 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 FEM1CQ96JP0 617 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 GPR78Q96P69 363 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CLSTN3Q9BQT9 956 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 MLST8Q9BVC4 326 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 HDHD5Q9BXW7 423 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 USP44Q9H0E7 712 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CYP4F11Q9HBI6 524 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TXNRD2Q9NNW7 524 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ANKEF1Q9NU02 776 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TMEM248Q9NWD8 314 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ASNSD1Q9NWL6 643 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 ASIC5Q9NY37 505 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 EHD2Q9NZN4 543 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CLDN16Q9Y5I7 305 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 PSAT1Q9Y617 370 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 PIAS3Q9Y6X2 628 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 EMSYQ7Z589 1322 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 KCNJ18B7U540 433 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 TAF4O00268 1085 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 STRNO43815 780 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 AHCYL1O43865 530 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 JTBO76095 146 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-658P-201ENST00000384606 HOXB5P09067 269 aa3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms