RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ATP11AP98196 1134 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 FANCCQ00597 558 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ACCSLQ4AC99 568 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RAB6CQ53S08 254 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC31Q6UY01 552 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 HAPLN3Q96S86 360 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PSMB7Q99436 277 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RAB6CQ9H0N0 254 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 MUC3BQ9H195 1237 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 FZD4Q9ULV1 537 aa24.13■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 E9PAM4 449 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 GJB6O95452 261 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SDC4P31431 198 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PTPN9P43378 593 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PTP4A2Q12974 167 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DLG2Q15700 870 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 HLA-BQ31612 363 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 LAYNQ6UX15 382 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SH2D3CQ8N5H7 860 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C3orf20Q8ND61 904 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TTYH3Q9C0H2 523 aa24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC72A6NJI9 287 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC53A6NM62 1247 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SNAP91O60641 907 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CER1O95813 267 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TPM3P06753 285 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 KRT3P12035 628 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 GOT1P17174 413 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SPINK2P20155 84 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DRD3P35462 400 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PRKCIP41743 596 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 METAP1P53582 386 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 UBASH3AP57075 661 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 KIF19Q2TAC6 998 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 LRSAM1Q6UWE0 723 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 MON1BQ7L1V2 547 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 STRADAQ7RTN6 431 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 OR2T34Q8NGX1 318 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 OR8D1Q8WZ84 308 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 EBF2Q9HAK2 575 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SARDHQ9UL12 918 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SNX11Q9Y5W9 270 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa24.11■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 A0A0D9SEW6 157 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1W2PQJ5 194 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C10orf142B7Z368 130 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 PLK4O00444 970 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SRGAP2O75044 1071 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 MT-CO1P00395 513 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SRCP12931 536 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TNFAIP3P21580 790 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 GRIA4P48058 902 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TEAD4Q15561 434 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ASIC2Q16515 512 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CDO1Q16878 200 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ARL13BQ3SXY8 428 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC14Q49A88 953 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ACAD10Q6JQN1 1059 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 Q6ZVU0 165 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 NAXDQ8IW45 347 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 OR14C36Q8NHC7 312 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SYT11Q9BT88 431 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RETREG1Q9H6L5 497 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 VPS51Q9UID3 782 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 HS3ST2Q9Y278 367 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 EPG5Q9HCE0 2579 aa24.1■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 A0A1W2PPC4 97 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD62A6NC57 917 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF883P0CG24 379 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DESP17661 470 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ADPRHP54922 357 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 KRT83P78385 493 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF212Q9UDV6 495 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 DOCK9Q9BZ29 2069 aa24.09■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 K7ERQ8 282 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 KCNK3O14649 394 aa24.08■■□□□ 1.45
FAAP20-201ENST00000378543 MCF2LO15068 1137 aa24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms