RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358572.9

TMA16-201, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMA16, Length 1,978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-201ENST00000358572 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.98■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 MICAL3Q7RTP6 2002 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SLC12A8A0AV02 714 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 COPEO14579 308 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 EDF1O60869 148 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 USP1O94782 785 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 DNAJB2P25686 324 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 TUFMP49411 452 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 MROH9Q5TGP6 573 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 FBXL22Q6P050 247 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 LINC00523Q86TU6 105 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 CHSY1Q86X52 802 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 IGSF8Q969P0 613 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 IL22Q9GZX6 179 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 DONSONQ9NYP3 566 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SLC17A6Q9P2U8 582 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 PHTF1Q9UMS5 762 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa15.97■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 TLR5O60602 858 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ANXA9O76027 345 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 CNTN5O94779 1100 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 RPL17P18621 184 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 CDH17Q12864 832 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SPRED3Q2MJR0 410 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SNX30Q5VWJ9 437 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 CNPY4Q8N129 248 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 TOP1MTQ969P6 601 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 APOL2Q9BQE5 337 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 PLLPQ9Y342 182 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 PSAT1Q9Y617 370 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ABLIM3O94929 683 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 HLA-DQB2P05538 268 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ERVK-10P10266 1014 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 RFC2P35250 354 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ADRA1AP35348 466 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 MTA1Q13330 715 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 RAP1GAP2Q684P5 730 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 TMEM39AQ9NV64 488 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SOX13Q9UN79 622 aa15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
TMA16-201ENST00000358572 SHROOM3Q8TF72 1996 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CRHR1P34998 444 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ANO4Q32M45 955 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 NADSYN1Q6IA69 706 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ACMSDQ8TDX5 336 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PTPRN2Q92932 1015 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HMCESQ96FZ2 354 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KIFC1Q9BW19 673 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MANSC1Q9H8J5 431 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 WDR91A4D1P6 747 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ATP9BO43861 1147 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 FSBPO95073 299 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SEC24AO95486 1093 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SOD2P04179 222 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 HMBSP08397 361 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TPH1P17752 444 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MAGEA9P43362 315 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 SERPINB4P48594 390 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 MFSD3Q96ES6 412 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CPNE1Q99829 537 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 TBL1YQ9BQ87 522 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 CHRAC1Q9NRG0 131 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa15.95■□□□□ 0.14
TMA16-201ENST00000358572 ZFATQ9P243 1243 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms