RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356183.8

GTF3C1-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C1, Length 7,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1-201ENST00000356183 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 PGK1P00558 417 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 GH1P01241 217 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC2A3P11169 496 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 IL18Q14116 193 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 AMER2Q8N7J2 671 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 TBL1YQ9BQ87 522 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 DMTF1Q9Y222 760 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 GLI2P10070 1586 aa11.2□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SALL3Q9BXA9 1300 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 BTN3A1O00481 513 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 UNC5CO95185 931 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FADS2O95864 444 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 EFEMP1Q12805 493 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 MED22Q15528 200 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 LDLRAP1Q5SW96 308 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 NOTUMQ6P988 496 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM131BQ86XD5 332 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FBXO32Q969P5 355 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A096LPK6 155 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CBX4O00257 560 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC37A4O43826 429 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 S100A3P33764 101 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.625e-7■■■■□ 22.1
GTF3C1-201ENST00000356183 MCL1Q07820 350 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 MTAPQ13126 283 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SMYD1Q8NB12 490 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 MGRN1O60291 552 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SHBGP04278 402 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 WEE1P30291 646 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FBXW8Q8N3Y1 598 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC47A1Q96FL8 570 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 DHRS7Q9Y394 339 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 ADGRB3O60242 1522 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 H3BMM5 538 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 PRLP01236 227 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 RRM1P23921 792 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SPIBQ01892 262 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 METTL6Q8TCB7 284 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 DLG3Q92796 817 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 AHSPQ9NZD4 102 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SSR3Q9UNL2 185 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CRYL1Q9Y2S2 319 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0G2JLW4 131 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 A0A0X1KG70 313 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 DRD4P21917 467 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 RXRBP28702 533 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 RHOAP61586 193 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 FAM171BQ6P995 826 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 DNAJB14Q8TBM8 379 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 APBB2Q92870 758 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SLC5A5Q92911 643 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 NMRAL1Q9HBL8 299 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 GPRC5CQ9NQ84 441 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CBFA2T3O75081 653 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CCNKO75909 580 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CST1P01037 141 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 RHOCP08134 193 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 MYBL2P10244 700 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 EPORP19235 508 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SCNN1BP51168 640 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 BTN3A2P78410 334 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CDC42EP1Q00587 391 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CBX3Q13185 183 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 IQSEC1Q6DN90 963 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 TMC7Q7Z402 723 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 KBTBD8Q8NFY9 601 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP11.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 26.8
GTF3C1-201ENST00000356183 FKBP14Q9NWM8 211 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 BAIAP2Q9UQB8 552 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.19□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 OR5F1O95221 314 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 ALADP13716 330 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 PRKAG1P54619 331 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CAMK1Q14012 370 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 GPAT3Q53EU6 434 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 BTBD9Q96Q07 612 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 CEP152O94986 1710 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 HIST1H2ABP04908 130 aa11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
GTF3C1-201ENST00000356183 BHLHB9Q6PI77 547 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms