RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAM32Q8TC27 787 aa21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MAPK15Q8TD08 544 aa21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 VPS39Q96JC1 886 aa21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 TSNARE1Q96NA8 513 aa21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 FBXW11Q9UKB1 542 aa21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 FYNP06241 537 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 UQCRBP14927 111 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 RAG1P15918 1043 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 CD68P34810 354 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ABCG1P45844 678 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 HK2P52789 917 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 HDAC11Q96DB2 347 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 UNCXA6NJT0 531 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 NRP1O14786 923 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 F7P08709 466 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM163BP0C2L3 166 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 NUMBP49757 651 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PRKAA2P54646 552 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ANO4Q32M45 955 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SFT2D3Q587I9 215 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 KBTBD6Q86V97 674 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MFN1Q8IWA4 741 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 AGR3Q8TD06 166 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ZFAND2BQ8WV99 257 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 OR52B2Q96RD2 323 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SLC39A10Q9ULF5 831 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 RAP2CQ9Y3L5 183 aa21.9■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MATN2O00339 956 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 PRPSAP1Q14558 356 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 TRIP10Q15642 601 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 WSCD1Q658N2 575 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 IQSEC1Q6DN90 963 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 NPWQ8N729 165 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINI1Q99574 410 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 MCMBPQ9BTE3 642 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 TASP1Q9H6P5 420 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 ANLNQ9NQW6 1124 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.89■■□□□ 1.1
PTDSS1-201ENST00000337004 RGSL1A5PLK6 1076 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 C9IYK1 514 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 HDAC3O15379 428 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 LTFP02788 710 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 NCAM1P13591 858 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 NFKB1P19838 968 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 PEX2P28328 305 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SERPINB5P36952 375 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 POLE2P56282 527 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GJA9P57773 515 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DAOAP59103 153 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX17Q15036 470 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 C16orf89Q6UX73 402 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CNDP1Q96KN2 507 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 APOL2Q9BQE5 337 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DRC3Q9H069 523 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 YJEFN3A6XGL0 299 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 PEX1O43933 1283 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 TPH1P17752 444 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GJA5P36382 358 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SATB1Q01826 763 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GALNT2Q10471 571 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CDH17Q12864 832 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB17Q13105 803 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 UBXN11Q5T124 520 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 LIPMQ5VYY2 423 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ZYG11AQ6WRX3 759 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DDIT4Q9NX09 232 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 GABRDO14764 452 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 VCLP18206 1134 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAJB2P25686 324 aa21.88■■□□□ 1.09
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms