RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 TNS4Q8IZW8 715 aa19.61■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 DCLRE1BQ9H816 532 aa19.61■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 PNPOQ9NVS9 261 aa19.61■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa19.61■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 A0A096LPK6 155 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MSI1O43347 362 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ARRB2P32121 409 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 CYP2C18P33260 490 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 PGFP49763 221 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SLC5A3P53794 718 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 BTBD8Q5XKL5 378 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ATPAF2Q8N5M1 289 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SPATA22Q8NHS9 363 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 TSGA13Q96PP4 275 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 TTC3P53804 2025 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 PAGE1O75459 146 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MPOP05164 745 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 TUBB3Q13509 450 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 PPP2R5DQ14738 602 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 TBCCQ15814 346 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 KCNA10Q16322 511 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 TMPRSS6Q8IU80 811 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 URGCPQ8TCY9 931 aa19.6■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SEPT4O43236 478 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 TIMM44O43615 452 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ADAMTS4O75173 837 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 CCNCP24863 283 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 GRIK1P39086 918 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 BRMS1LQ5PSV4 323 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 BEND5Q7L4P6 421 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MAVSQ7Z434 540 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 LINC00523Q86TU6 105 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SAPCD2Q86UD0 394 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ARHGAP24Q8N264 748 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ACVR1CQ8NER5 493 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 WDR60Q8WVS4 1066 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SUSD3Q96L08 255 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 HAPLN3Q96S86 360 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ABCC13Q9NSE7 274 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 MYO16Q9Y6X6 1858 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 CEP350Q5VT06 3117 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 PSMD3O43242 534 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 SLC10A3P09131 477 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 CDK7P50613 346 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 ZNF33AQ06730 810 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 CASP10Q92851 521 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 VPS39Q96JC1 886 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 UROC1Q96N76 676 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 YY1AP1Q9H869 796 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
USP21-201ENST00000289865 AP3B1O00203 1094 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 C2P06681 752 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 OR4Q2P0C623 313 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 CCR1P32246 355 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 FLT3LGP49771 235 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 INHBEP58166 350 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 TAF11Q15544 211 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 CLEC14AQ86T13 490 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 GPATCH11Q8N954 259 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 TBL1YQ9BQ87 522 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 KIFC1Q9BW19 673 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 SLC39A8Q9C0K1 460 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 SMOC2Q9H3U7 446 aa19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 CACNG3O60359 315 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 KRT36O76013 467 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 HARS2P49590 506 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 FCGRTP55899 365 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 RCN1Q15293 331 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 IPMKQ8NFU5 416 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 FAM161BQ96MY7 647 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 MCMBPQ9BTE3 642 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 NMRK2Q9NPI5 230 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 NDFIP2Q9NV92 336 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 DNAJC28Q9NX36 388 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 SLC39A10Q9ULF5 831 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 G3V2L1 256 aa19.57■□□□□ 0.72
USP21-201ENST00000289865 TNFRSF10BO14763 440 aa19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms