RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 GPSM1Q86YR5 675 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 WDR48Q8TAF3 677 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ACTL9Q8TC94 416 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ADAM33Q9BZ11 813 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PRDM8Q9NQV8 689 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GGA2Q9UJY4 613 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BCL9O00512 1426 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 A0A096LPK6 155 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 A0A0A0MRY4 1105 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 DPYSL3Q14195 570 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PAGE2Q7Z2X7 111 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 S100A3P33764 101 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TTPAP49638 278 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 ARMC3Q5W041 872 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 KRT74Q7RTS7 529 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SYT12Q8IV01 421 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 DNAJB3Q8WWF6 145 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SETD4Q9NVD3 440 aa7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 GAKO14976 1311 aa7.33□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 WARSP23381 471 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 DEFB106AQ8N104 65 aa7.32□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 ITFG1Q8TB96 612 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RNFT2Q96EX2 444 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CIPCQ9C0C6 399 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.32□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 L1RE1Q9UN81 338 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RGS5O15539 181 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATP9AO75110 1047 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 BCL10O95999 233 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 CATP04040 527 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LGALS2P05162 132 aa7.32□□□□□ -1.24
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CPS1-201ENST00000233072 TNK2Q07912 1038 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 NFIL3Q16649 462 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 LY6KQ17RY6 165 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 RNF43Q68DV7 783 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ZNF470Q6ECI4 717 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POLNQ7Z5Q5 900 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 SLC9A9Q8IVB4 645 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PHC3Q8NDX5 983 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 OR52L1Q8NGH7 329 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TINF2Q9BSI4 451 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 FUCA2Q9BTY2 467 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 HGH1Q9BTY7 390 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.32□□□□□ -1.24
CPS1-201ENST00000233072 PCYOX1Q9UHG3 505 aa7.32□□□□□ -1.24
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