RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LZTS1Q9Y250 596 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 INSL6Q9Y581 213 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NR2E3Q9Y5X4 410 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 VWA8A3KMH1 1905 aa9.75□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SCN5AQ14524 2016 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MICAL3Q7RTP6 2002 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MAGEB16A2A368 324 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGAP42A6NI28 874 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 DFFAO00273 331 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ACSL4O60488 711 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LATS1O95835 1130 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 C1RP00736 705 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 JCHAINP01591 159 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CCNB1P14635 433 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 GRIA1P42261 906 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MSH2P43246 934 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC11A2P49281 568 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HARS2P49590 506 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 EPHB3P54753 998 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 GUCY1A3Q02108 690 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FPGSQ05932 587 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 DMTNQ08495 405 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TWF1Q12792 350 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NAB1Q13506 487 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PARP15Q460N3 678 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LILRA6Q6PI73 481 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LEKR1Q6ZMV7 388 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 UNC5AQ6ZN44 842 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RTL10Q7L3V2 364 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00523Q86TU6 105 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MIB1Q86YT6 1006 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CNTD1Q8N815 330 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NETO2Q8NC67 525 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 DCAKDQ8WVC6 231 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 HERVK_113Q902F9 699 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TTC17Q96AE7 1141 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PAFAH2Q99487 392 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RAD9AQ99638 391 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 EPN3Q9H201 632 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC40Q9H9A6 602 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 GLOD4Q9HC38 313 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PRDM9Q9NQV7 894 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MOCS1Q9NZB8 636 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MPP6Q9NZW5 540 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 STOML2Q9UJZ1 356 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 INSL5Q9Y5Q6 135 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 IRAK3Q9Y616 596 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LTBP2Q14767 1821 aa9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PLXNA3P51805 1871 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM159BA6NKW6 160 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RASA4BC9J798 803 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PRRG1O14668 218 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RASA4O43374 803 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 COCHO43405 550 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ANXA9O76027 345 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 OLFM2O95897 454 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PEX11BO96011 259 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 F11P03951 625 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PFKLP17858 780 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PGAM1P18669 254 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NFKB1P19838 968 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TACR2P21452 398 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NPY2RP49146 381 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RENBPP51606 427 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TMED2Q15363 201 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TAF12Q16514 161 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ALFQ53S48 1182 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TMEM240Q5SV17 173 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 RAP1GAP2Q684P5 730 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 NADSYN1Q6IA69 706 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 SLC26A11Q86WA9 606 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 LRRC6Q86X45 466 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CHSY1Q86X52 802 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 TEX26Q8N6G2 289 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 MZB1Q8WU39 189 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa9.73□□□□□ -0.85
APOBEC1-201ENST00000229304 BADQ92934 168 aa9.73□□□□□ -0.85
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