RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mkrn3Q60764 544 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc23Q8CHY7 488 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LzicQ8K3C3 190 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8R1Y2 203 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp2r2dQ925E7 453 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrfap1Q9CQL7 125 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IgtpQ9DCE9 423 aa13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map1bP14873 2464 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Myh4Q5SX39 1939 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm13212B1ASQ7 799 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5861F6VCN9 180 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 4933402N22RikF7D1B3 190 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AcrP23578 436 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PuraP42669 321 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snrpd1P62315 119 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf354cQ571J5 560 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 HadhQ61425 314 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VclQ64727 1066 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acsl5Q8JZR0 683 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssh3Q8K330 649 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aim2Q91VJ1 354 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 RragcQ99K70 398 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gid8Q9D7M1 228 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mapk9Q9WTU6 423 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Irs2P81122 1321 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trmt1lA2RSY6 728 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Banf1O54962 89 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PdgfrbP05622 1098 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbxas1P36423 533 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Epb41l4aP52963 686 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sem1P60897 70 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim43cP86449 446 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa4P97429 319 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef33Q8BW86 850 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr59Q8C0M0 992 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Clec4a3Q8JZX6 237 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx5Q8K1E0 355 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tas1r1Q99PG6 842 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpl17Q9CPR4 184 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syf2Q9D198 242 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fip1l1Q9D824 581 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nup50Q9JIH2 466 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cacng4Q9JJV4 327 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Copg2Q9QXK3 871 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl41A2AUC9 606 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn2r4K7N784 913 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mmp15O54732 657 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SarsP26638 512 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh3a1P47739 453 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pkn1P70268 946 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp7Q6A4J8 1103 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nemp1Q6ZQE4 437 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc18a2Q8BRU6 517 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dennd1cQ8CFK6 786 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sugp1Q8CH02 643 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Syn3Q8JZP2 579 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ecrg4Q99LS0 148 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pbld2Q9CXN7 288 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Map2k5Q9WVS7 448 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam171a2A2A699 822 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam46dB1ATX6 390 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Srp72F8VQC1 671 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DselQ0VBN2 1207 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arid5aQ3U108 590 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndrg1Q62433 394 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nrg1Q6DR99 700 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdh19Q80TF3 1145 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 1700001K19RikQ80ZT1 219 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q8BHN7 327 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpc2Q8BKV1 579 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Oit3Q8R4V5 546 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb17Q91VD8 799 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9CQC3 228 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vwa7Q9JHA8 891 aa13.03□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cntnap4Q99P47 1310 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pramef20B1ARV6 477 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smok3aC0HKC8 504 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smok3bC0HKC9 504 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc62E9PVD1 701 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm2832F7AEC7 200 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gsg1l2M0QWL6 290 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pbx3O35317 434 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hk1P17710 974 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Msr1P30204 458 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AcadmP45952 421 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il1rapl1P59823 695 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CenplQ3U3S3 329 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpa1Q8BLA8 1125 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rmdn2Q8BSE0 410 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vmn1r218Q8R261 298 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdha5Q91Y15 934 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpgs1Q99MS8 303 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cyp3a44Q9EQW4 504 aa13.02□□□□□ -0.32
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr18Q4VBE8 431 aa13.02□□□□□ -0.33
Pkp1-201ENSMUST00000027667 OgdhQ60597 1023 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 11 ms