RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SORT1	Q99523	831 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	STOML1	Q9UBI4	398 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	HTT	P42858	3142 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152		A0A096LPK6	155 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	HHLA1	C9JL84	531 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	ABL2	P42684	1182 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SLC25A3	Q00325	362 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM135	Q86UB9	458 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	KCNMB4	Q86W47	210 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MAB21L3	Q8N8X9	362 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NRG4	Q8WWG1	115 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM209	Q96SK2	561 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	GBA3	Q9H227	469 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		13.37	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	LOC100653049	A0A140TA62	436 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	KRT34	O76011	436 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MX2	P20592	715 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NMBR	P28336	390 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SCAP	Q12770	1279 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	RAB41	Q5JT25	222 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152		F8W810	466 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NCAM2	O15394	837 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNA1	P02708	482 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	LIMK2	P53671	638 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	HUNK	P57058	714 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MPP3	Q13368	585 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TUBB3	Q13509	450 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	PEX6	Q13608	980 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	RAPH1	Q70E73	1250 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	HDAC11	Q96DB2	347 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	APBA2	Q99767	749 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CASS4	Q9NQ75	786 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		13.36	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SIN3B	O75182	1162 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	USP1	O94782	785 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	C2	P06681	752 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB6	P35237	376 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	AVPR1A	P37288	418 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	IDH3A	P50213	366 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NAB1	Q13506	487 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TRPV2	Q9Y5S1	764 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152		C9IYK1	514 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	PCSK1	P29120	753 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	GLRB	P48167	497 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CXCR3	P49682	368 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SERPINB8	P50452	374 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	AIF1	P55008	147 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	GJA9	P57773	515 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	GALNT2	Q10471	571 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	UPP1	Q16831	310 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CNTD1	Q8N815	330 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	URGCP	Q8TCY9	931 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		13.35	□□□□□ -0.27
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G4C	Q9UP65	541 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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