RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 CACUL1Q86Y37 369 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM176AQ96HP8 235 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 UVRAGQ9P2Y5 699 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 RAXQ9Y2V3 346 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 MRFAP1Q9Y605 127 aa24.95■■□□□ 1.59
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM131Q92545 1883 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP12O43422 761 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CER1O95813 267 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 VDRP11473 427 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-EP13747 358 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 STILQ15468 1287 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TPCN2Q8NHX9 752 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC35G2Q8TBE7 412 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 UCMAQ8WVF2 138 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 THAP2Q9H0W7 228 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM245Q9H330 911 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MARCH2Q9P0N8 246 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 DKK4Q9UBT3 224 aa24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 URB1O60287 2271 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ACSL1P33121 698 aa24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-216ENST00000628306 NOMO3P69849 1222 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CAMK2BQ13554 666 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CNGA2Q16280 664 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF394Q53GI3 561 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGZQ86VD9 579 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MCOLN2Q8IZK6 566 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC57Q8N9N7 239 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC4A11Q8NBS3 891 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC2A11Q9BYW1 496 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN6Q9BZV1 441 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PCED1AQ9H1Q7 454 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCO5BA8MYB1 307 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 EPHX1P07099 455 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-216ENST00000628306 TUBB4BP68371 445 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF19Q2TAC6 998 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 IL27RAQ6UWB1 636 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM124AQ86V42 546 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2T3Q8NH03 318 aa24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ORAI3Q9BRQ5 295 aa24.93■■□□□ 1.58
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CAPNS1-216ENST00000628306 SLC12A8A0AV02 714 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 BUB1O43683 1085 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PALMO75781 387 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SLU7O95391 586 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HLA-FP30511 346 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNT1Q5JUK3 1230 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PM20D1Q6GTS8 502 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX11Q9Y5W9 270 aa24.92■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TULP2O00295 520 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 FLRT2O43155 660 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TCP1P17987 556 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCB4P21439 1286 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRNQ16849 979 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF366Q8N895 744 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 DDI1Q8WTU0 396 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TFAP2BQ92481 460 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSWIM1Q9BR11 485 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 OSGEPQ9NPF4 335 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 STOML2Q9UJZ1 356 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX12Q9UMY4 172 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP83Q9Y592 693 aa24.91■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ASXL3Q9C0F0 2248 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 TIMM44O43615 452 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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CAPNS1-216ENST00000628306 MMP8P22894 467 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP17Q68EM7 881 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 LAYNQ6UX15 382 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 MON1BQ7L1V2 547 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 ADIPOR2Q86V24 386 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 RHBDD1Q8TEB9 315 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa24.9■■□□□ 1.58
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
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