RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 IGFLR1Q9H665 355 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GVM2 712 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 MATN3O15232 486 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 RGS19P49795 217 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 TDP1Q9NUW8 608 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 IGSF9Q9P2J2 1179 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa25.47■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 ITFG1Q8TB96 612 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF576Q9H609 170 aa25.46■■□□□ 1.67
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-215ENST00000628018 PEX11BO96011 259 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 GAD2Q05329 585 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA8MH3BSY2 632 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 J3KR12 359 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-215ENST00000628018 PSMB4P28070 264 aa25.43■■□□□ 1.66
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CAPNS1-215ENST00000628018 AGAP3Q96P47 875 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.661e-7■■■□□ 16.1
CAPNS1-215ENST00000628018 PHACTR1Q9C0D0 580 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0D9SEW6 157 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ILVBLA1L0T0 632 aa25.42■■□□□ 1.66
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