RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627662.1

DUX4L1-201, Transcript of double homeobox 4 like 1, humanhuman

BASIC

Gene DUX4L1, Length 1,275 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L1-201ENST00000627662 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 STK40Q8N2I9 435 aa22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 TMEM35BQ8NCS4 154 aa22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 SYNCQ9H7C4 482 aa22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 PIGVQ9NUD9 493 aa22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 IFNKQ9P0W0 207 aa22.17■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 CBFA2T2O43439 604 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 CBFA2T3O75081 653 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 PROS1P07225 676 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 ZNF883P0CG24 379 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 CD27P26842 260 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 GABRB2P47870 512 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 KIF19Q2TAC6 998 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 C5orf22Q49AR2 442 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 AADATQ8N5Z0 425 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 FRS2Q8WU20 508 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 GATA6Q92908 595 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 NT5C3BQ969T7 300 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 NEUROG2Q9H2A3 272 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 OR51B4Q9Y5P0 310 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 DOCK4Q8N1I0 1966 aa22.16■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 ADCY5O95622 1261 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 LSM8O95777 96 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 CER1O95813 267 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 FERP16591 822 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 SLC8A1P32418 973 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 GRIA4P48058 902 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 PSMD8P48556 350 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 GALCP54803 685 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 CDR2Q01850 454 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 C2CD6Q53TS8 623 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 KCNT1Q5JUK3 1230 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 XYLT1Q86Y38 959 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 GANCQ8TET4 914 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 EBF2Q9HAK2 575 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 TM7SF3Q9NS93 570 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 KLK13Q9UKR3 277 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 SNX11Q9Y5W9 270 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.15■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.14■■□□□ 1.14
DUX4L1-201ENST00000627662 MMEP08473 750 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 PBX1P40424 430 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 CXCR3P49682 368 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 SULT2A1Q06520 285 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 FIGNQ5HY92 759 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 ARTNQ5T4W7 220 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 TRNP1Q6NT89 227 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 NCEH1Q6PIU2 408 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 ZNF683Q8IZ20 524 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 MSANTD4Q8NCY6 345 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 C18orf8Q96DM3 657 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 IQCDQ96DY2 449 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 FEM1AQ9BSK4 669 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 TKTL2Q9H0I9 626 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 RRN3Q9NYV6 651 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 FZD4Q9ULV1 537 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 DOCK9Q9BZ29 2069 aa22.14■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 CNTN5O94779 1100 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 FLT3P36888 993 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 SCNN1AP37088 669 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 SULT1E1P49888 294 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 VASPP50552 380 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 METAP1P53582 386 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 MTA1Q13330 715 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 ALFQ53S48 1182 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 TRIM72Q6ZMU5 477 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 BAP1Q92560 729 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 TBCBQ99426 244 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 SIK2Q9H0K1 926 aa22.13■■□□□ 1.13
DUX4L1-201ENST00000627662 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms