RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	UST	Q9Y2C2	406 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TTC34	A8MYJ7	566 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TLR5	O60602	858 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN3	O60637	253 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	UNC5C	O95185	931 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAMEF12	O95522	483 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP11B1	P15538	503 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TNFAIP3	P21580	790 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	YWHAE	P62258	255 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CLDN10	P78369	228 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TBL3	Q12788	808 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CUL1	Q13616	776 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ASIC2	Q16515	512 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LILRA6	Q6PI73	481 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	RNF139	Q8WU17	664 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SKA1	Q96BD8	255 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS50	Q96JG6	964 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ASB2	Q96Q27	587 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DPH5	Q9H2P9	285 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SIX2	Q9NPC8	291 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	LIMA1	Q9UHB6	759 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	IRAK3	Q9Y616	596 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CFAP54	Q96N23	3096 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	YJEFN3	A6XGL0	299 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FSCN2	O14926	492 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BNIP3L	O60238	219 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TBC1D4	O60343	1298 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NOL4	O94818	638 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ABLIM3	O94929	683 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC159	P0C7I6	412 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GDI1	P31150	447 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA5	Q16718	116 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ANO4	Q32M45	955 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	IER5L	Q5T953	404 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PDXDC1	Q6P996	788 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NUP93	Q8N1F7	819 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CPXM1	Q96SM3	734 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BRD9	Q9H8M2	597 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	MAPK13	O15264	365 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP11A1	P05108	521 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GLI1	P08151	1106 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	EMP3	P54852	163 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GPC5	P78333	572 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NFIL3	Q16649	462 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TPGS2	Q68CL5	300 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZNX1	250 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR149	Q86SP6	731 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC3H8	Q8N5P1	291 aa	Known RBP eCLIP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NETO2	Q8NC67	525 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	GBA3	Q9H227	469 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	NMUR1	Q9HB89	426 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CPQ	Q9Y646	472 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC12A8	A0AV02	714 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495		E9PBE3	544 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CSH1	P0DML2	217 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	CSH2	P0DML3	217 aa		7.41	□□□□□ -1.22
LETMD1-238	ENST00000623495	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22

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