RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607941.5

SYT6-202, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYT6, Length 4,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-202ENST00000607941 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 NEPROQ6NW34 567 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 LCLAT1Q6UWP7 414 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 B3GALT6Q96L58 329 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 WDR41Q9HAD4 459 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 HPS4Q9NQG7 708 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SLIT2O94813 1529 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SPDYE5A6NIY4 337 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GUCA1CO95843 209 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 OR4Q2P0C623 313 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SP100P23497 879 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 IVDP26440 423 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 CNTFP26441 200 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 HDAC4P56524 1084 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MARC1Q5VT66 337 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TMEM198Q66K66 360 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ZNF570Q96NI8 536 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 CPNE1Q99829 537 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ZNF670Q9BS34 389 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TRIM15Q9C019 465 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 LHX5Q9H2C1 402 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 CASS4Q9NQ75 786 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PKP3Q9Y446 797 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ATRNL1Q5VV63 1379 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MYO1GB0I1T2 1018 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 CBX4O00257 560 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ITM2AO43736 263 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 F9P00740 461 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ME2P23368 584 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GEMP55040 296 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PRKAA1Q13131 559 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GRTP1Q5TC63 336 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 FBXO32Q969P5 355 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 LRRC39Q96DD0 335 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TSPAN17Q96FV3 270 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MPP4Q96JB8 637 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 HAUS8Q9BT25 410 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 HAPLN2Q9GZV7 340 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MID1IP1Q9NPA3 183 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 DTLQ9NZJ0 730 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ZNF212Q9UDV6 495 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 EGFL7Q9UHF1 273 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 CNTNAP1P78357 1384 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 NEMP2A6NFY4 417 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PEX11AO75192 247 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MT-ND1P03886 318 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GSTT1P30711 240 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MATKP42679 507 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 RALGDSQ12967 914 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PTP4A2Q12974 167 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 INPP5AQ14642 412 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SOWAHAQ2M3V2 549 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ZNF618Q5T7W0 954 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TTC30AQ86WT1 665 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TTC30BQ8N4P2 665 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PEBP4Q96S96 227 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GPR63Q9BZJ6 419 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 RNF112Q9ULX5 631 aa10□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MYH7BA7E2Y1 1941 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SLC15A5A6NIM6 579 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MRASO14807 208 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 STX7O15400 261 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 RPL14P50914 215 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 POU4F1Q01851 419 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MBTD1Q05BQ5 628 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TBCCQ15814 346 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 PFKFB4Q16877 469 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ZNF781Q8N8C0 355 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GIPC2Q8TF65 315 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 RNF39Q9H2S5 420 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 RUBCNLQ9H714 662 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ZNF839A8K0R7 811 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 MDM4O15151 490 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GRIN3BO60391 1043 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 SIN3BO75182 1162 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 ODC1P11926 461 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 GSSP48637 474 aa9.99□□□□□ -0.81
SYT6-202ENST00000607941 KCNK10P57789 538 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms