RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SORCS3Q9UPU3 1222 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GIT1Q9Y2X7 761 aa9.43□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MAGEB16A2A368 324 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PTGESO14684 152 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DCLK1O15075 740 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GYG2O15488 501 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 HCRTO43612 131 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 AP2A1O95782 977 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 LTFP02788 710 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 THP07101 528 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL2P10916 166 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SKIP12755 728 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GRK2P25098 689 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MGAT1P26572 445 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PSMB4P28070 264 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ADRA1BP35368 520 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 HADHAP40939 763 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CDK7P50613 346 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MAP3K7CLP57077 242 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PURAQ00577 322 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE1BQ01064 536 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 OVGP1Q12889 678 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 STX3Q13277 289 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC153Q494R4 210 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAL1Q4LDG9 190 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GRTP1Q5TC63 336 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf163Q5TEZ5 329 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MROH9Q5TGP6 573 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMC3Q5W041 872 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 BEND5Q7L4P6 421 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SCML4Q8N228 414 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPRN2Q92932 1015 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 HDAC11Q96DB2 347 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SENP8Q96LD8 212 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 UROC1Q96N76 676 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TSNARE1Q96NA8 513 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 LGMNQ99538 433 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 LPIN3Q9BQK8 851 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 BTBD10Q9BSF8 475 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ULBP1Q9BZM6 244 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC13A1Q9BZW2 595 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GBA3Q9H227 469 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL16Q9H2A7 254 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 THAP1Q9NVV9 213 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 COX16Q9P0S2 106 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CPA4Q9UI42 421 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FCHO1O14526 889 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR182O15218 404 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM44O43615 452 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SNNO75324 88 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CIB2O75838 187 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PIAS1O75925 651 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 USP1O94782 785 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CBX6O95503 412 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGB2P05107 769 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINE1P05121 402 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MPOP05164 745 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 APOA4P06727 396 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 NCAM1P13591 858 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINB3P29508 390 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MLH1P40692 756 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 NPY2RP49146 381 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CCNG1P51959 295 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 OCRLQ01968 901 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 BST1Q10588 318 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX44Q53QW1 395 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB41Q5JT25 222 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF618Q5T7W0 954 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PID1Q7Z2X4 250 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00523Q86TU6 105 aa9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms