RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583514.5

LLGL2-221, Transcript of LLGL2, scribble cell polarity complex component, human

TSL 3

Gene LLGL2, Length 409 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LLGL2-221	ENST00000583514	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SCML1	Q9UN30	329 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		16.05	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM221B	A6H8Z2	402 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	KCNK3	O14649	394 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	MID1	O15344	667 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CD27	P26842	260 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	NUMB	P49757	651 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ECT2L	Q008S8	904 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CST6	Q15828	149 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SMYD5	Q6GMV2	418 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	USP30	Q70CQ3	517 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PASD1	Q8IV76	773 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ADAMTS14	Q8WXS8	1223 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM81B	Q96LP2	452 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CPXM1	Q96SM3	734 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	COX16	Q9P0S2	106 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		16.04	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	LAMA5	O15230	3695 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	EDDM13	A0A1B0GTR0	161 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514		A0A1W2PP55	124 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514		F5H5T6	163 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	GRAP2	O75791	330 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	IGHV4-34	P06331	123 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CCDC175	P0C221	793 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ABCB4	P21439	1286 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PON1	P27169	355 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	GRIA4	P48058	902 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	GALC	P54803	685 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	KCNMA1	Q12791	1236 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	DEFB106A	Q8N104	65 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SHC3	Q92529	594 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	RNF34	Q969K3	372 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	FAM129B	Q96TA1	746 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	OMD	Q99983	421 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	DDIT4	Q9NX09	232 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		16.03	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	GLI1	P08151	1106 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC2A3	P11169	496 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PDGFRA	P16234	1089 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC8A1	P32418	973 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PSMD8	P48556	350 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SUZ12	Q15022	739 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	GLRX5	Q86SX6	157 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	STK40	Q8N2I9	435 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PPP2R2C	Q9Y2T4	447 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		16.02	■□□□□ 0.16
LLGL2-221	ENST00000583514	CACNA1G	O43497	2377 aa		16.02	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		16.02	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	ITPR1	Q14643	2758 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	LRRC72	A6NJI9	287 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514		H0Y8X5	98 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	FLRT2	O43155	660 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	HSF2BP	O75031	334 aa		16.01	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	16.01	■□□□□ 0.15
LLGL2-221	ENST00000583514	CCR1	P32246	355 aa		16.01	■□□□□ 0.15

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