RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 MORF4L2Q15014 288 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ZMYND11Q15326 602 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 KYNUQ16719 465 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SMU1Q2TAY7 513 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MYLK3Q32MK0 819 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CTXN3Q4LDR2 81 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 FAM209BQ5JX69 171 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SPDYAQ5MJ70 313 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 FBXO47Q5MNV8 452 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 SLC22A25Q6T423 547 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ZNF852Q6ZMS4 543 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 RHPN2Q8IUC4 686 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 SLC43A2Q8N370 569 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CCNYL1Q8N7R7 359 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 ENGASEQ8NFI3 743 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 SPDL1Q96EA4 605 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SUGCTQ9HAC7 445 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 C17orf75Q9HAS0 396 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 C12orf4Q9NQ89 552 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CAMK2AQ9UQM7 478 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 INVSQ9Y283 1065 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RNF114Q9Y508 228 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SNX9Q9Y5X1 595 aa5.66□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TSPOAP1O95153 1857 aa5.66□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PPW3 197 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 A0A1W2PPZ6 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 DBX1A6NMT0 343 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 O00370 1275 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TO15178 435 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PCDHGA12O60330 932 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 EXOC3O60645 756 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 JAK2O60674 1132 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PFKFB2O60825 505 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TAF5LO75529 589 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RPS6KA5O75582 802 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 BEST1O76090 585 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 GCNT3O95395 438 aa5.65□□□□□ -1.5
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CAPN3-211ENST00000562199 HMGN1P05114 100 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINF2P08697 491 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ATF6P18850 670 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TYMPP19971 482 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CHRM3P20309 590 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 MAOBP27338 520 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PCGF2P35227 344 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ADMP35318 185 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 GRIA4P48058 902 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 NT5C2P49902 561 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RAB14P61106 215 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 RNF4P78317 190 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PDE1BQ01064 536 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 CREB5Q02930 508 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 TLE2Q04725 743 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PPARAQ07869 468 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 PCDH1Q08174 1060 aa5.65□□□□□ -1.5
CAPN3-211ENST00000562199 ELP6Q0PNE2 266 aa5.65□□□□□ -1.5
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