RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	SNAP91	O60641	907 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ACSL1	P33121	698 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SULT2A1	Q06520	285 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	STPG1	Q5TH74	334 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	LRRC31	Q6UY01	552 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	STK40	Q8N2I9	435 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	RTKN	Q9BST9	563 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		21.44	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MT-CO1	P00395	513 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	RHOC	P08134	193 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SDHB	P21912	280 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MAOB	P27338	520 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	OXTR	P30559	389 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	NRG1	Q02297	640 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ZBTB16	Q05516	673 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MAMLD1	Q13495	774 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	NUP58	Q9BVL2	599 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MUC3B	Q9H195	1237 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	OR12D3	Q9UGF7	316 aa		21.43	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996		A0A1W2PQJ5	194 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	TM4SF5	O14894	197 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ATP9B	O43861	1147 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	GLDC	P23378	1020 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	HOXD12	P35452	270 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CST6	Q15828	149 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CADM4	Q8NFZ8	388 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	OR7D4	Q8NG98	312 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	NTAN1	Q96AB6	310 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CNPY3	Q9BT09	278 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	TRIM7	Q9C029	511 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CAPN10	Q9HC96	672 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	VPS51	Q9UID3	782 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		21.42	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PI4KA	P42356	2102 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996		K7ERQ8	282 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MID1	O15344	667 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	LRIG2	O94898	1065 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DNTT	P04053	509 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	GYPC	P04921	128 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	OR1E1	P30953	314 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	METAP1	P53582	386 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SCAP	Q12770	1279 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	NLRP14	Q86W24	1093 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PYROXD2	Q8N2H3	581 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	FOXJ1	Q92949	421 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CACNA1E	Q15878	2313 aa		21.41	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	C4orf47	A7E2U8	309 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	METTL12	A8MUP2	240 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ZMPSTE24	O75844	475 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CFI	P05156	583 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	GZMA	P12544	262 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SRC	P12931	536 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	PSMD8	P48556	350 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DLG2	Q15700	870 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DUOXA1	Q1HG43	343 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996		Q6ZVU0	165 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DRC7	Q8IY82	874 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		21.4	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	KNL1	Q8NG31	2342 aa		21.39	■■□□□ 1.02
CS-222	ENST00000550996	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	21.39	■■□□□ 1.01
CS-222	ENST00000550996	ILVBL	A1L0T0	632 aa		21.39	■■□□□ 1.01

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