RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549738.5

GNPTAB-205, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, human

TSL 4

Gene GNPTAB, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTAB-205	ENST00000549738	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	UROC1	Q96N76	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	HTATIP2	Q9BUP3	242 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TBX20	Q9UMR3	447 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	GDA	Q9Y2T3	454 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	NCAN	O14594	1321 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738		A0A1W2PPH5	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738		H7C0S8	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	JTB	O76095	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	GC	P02774	474 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TNNT1	P13805	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TACR2	P21452	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PRPH2	P23942	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	AVPR2	P30518	371 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	KIF5B	P33176	963 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	MVD	P53602	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	KCNB1	Q14721	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CNGA3	Q16281	694 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	NAA35	Q5VZE5	725 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PREB	Q9HCU5	417 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	THAP1	Q9NVV9	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	PRRG2	O14669	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	DOK2	O60496	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	EXOC3	O60645	756 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CNTN5	O94779	1100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SGPL1	O95470	568 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	METTL18	O95568	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	LYL1	P12980	280 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	IDUA	P35475	653 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SHC2	P98077	582 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	B4GALNT1	Q00973	533 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CDC16	Q13042	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SLC14A1	Q13336	389 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TTC31	Q49AM3	519 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	ZNF398	Q8TD17	642 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	GPR78	Q96P69	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	CLPB	Q9H078	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GNPTAB-205	ENST00000549738	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms